More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0837 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01980  multidrug efflux system, subunit B  48.68 
 
 		 1040 aa  922    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01981  multidrug efflux system, subunit C  48.33 
 
 		 1025 aa  869    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1580  acriflavin resistance protein  48.33 
 
 		 1025 aa  868    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0262852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1581  acriflavin resistance protein  48.68 
 
 		 1040 aa  922    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.95 
 
 		 1032 aa  869    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1363  multidrug resistance protein MdtB  52.29 
 
 		 1036 aa  967    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3583  acriflavin resistance protein  43.21 
 
 		 1035 aa  784    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2685  multidrug efflux system subunit MdtB  48.29 
 
 		 1040 aa  940    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03142  drug efflux pump transmembrane protein  51.46 
 
 		 1041 aa  998    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  50.1 
 
 		 1033 aa  934    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2584  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.76 
 
 		 1048 aa  928    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753558  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  82.03 
 
 		 1034 aa  1688    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.582807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2755  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.84 
 
 		 1035 aa  817    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1644  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.66 
 
 		 1048 aa  925    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0374438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1128  acriflavin resistance protein  82.38 
 
 		 1034 aa  1679    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0555006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2483  acriflavin resistance protein  50.87 
 
 		 1036 aa  950    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.137837  normal  0.300491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2484  acriflavin resistance protein  43.11 
 
 		 1035 aa  814    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  47.47 
 
 		 1029 aa  897    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0570  acriflavin resistance protein  49.81 
 
 		 1103 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0571  acriflavin resistance protein  51.03 
 
 		 1046 aa  965    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3425  acriflavin resistance protein  44.13 
 
 		 1065 aa  834    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2319  RND efflux transporter  41.07 
 
 		 1023 aa  697    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1265  acriflavin resistance protein  51.62 
 
 		 1044 aa  993    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1521  acriflavin resistance protein  45.59 
 
 		 1032 aa  845    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0510494  normal  0.0716903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1522  acriflavin resistance protein  48.44 
 
 		 1040 aa  916    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0134  acriflavin resistance protein  45.53 
 
 		 1065 aa  850    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1500  AcrB/AcrD/AcrF family protein  52.58 
 
 		 1036 aa  974    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2671  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.66 
 
 		 1048 aa  926    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2522  acriflavin resistance protein  51.81 
 
 		 1034 aa  979    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984252  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2523  acriflavin resistance protein  43.67 
 
 		 1035 aa  828    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4662  acriflavin resistance protein  79.57 
 
 		 1033 aa  1664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3934  multidrug ABC transporter  45.06 
 
 		 1035 aa  826    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.962709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4305  acriflavin resistance protein  50.88 
 
 		 1037 aa  922    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0526146  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  44.94 
 
 		 1037 aa  877    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1970  acriflavin resistance protein  44.76 
 
 		 1029 aa  832    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1950  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.95 
 
 		 1048 aa  933    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2867  AcrB/AcrD/AcrF family protein  52.18 
 
 		 1036 aa  967    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3536  putative component of multidrug efflux pump, mdtB-like protein  50.74 
 
 		 1048 aa  1045    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  43.63 
 
 		 1041 aa  788    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  45.19 
 
 		 1042 aa  850    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2900  acriflavin resistance protein  44.95 
 
 		 1037 aa  825    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0921711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2901  acriflavin resistance protein  48.92 
 
 		 1038 aa  908    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0661735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0379  acriflavin resistance protein  46.46 
 
 		 1024 aa  824    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  46.13 
 
 		 1041 aa  873    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2559  acriflavin resistance protein  49.85 
 
 		 1042 aa  923    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2560  acriflavin resistance protein  44.11 
 
 		 1034 aa  829    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478642  normal  0.875545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0743  acriflavin resistance protein  48.53 
 
 		 1044 aa  905    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0744  acriflavin resistance protein  45.61 
 
 		 1051 aa  789    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.842453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2827  acriflavin resistance protein  47.4 
 
 		 1052 aa  830    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.68497  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2828  acriflavin resistance protein  44.17 
 
 		 1107 aa  861    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376428  normal  0.152401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2908  multidrug efflux system protein  50.59 
 
 		 1040 aa  890    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442487  normal  0.66419 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1233  acriflavin resistance protein  48.13 
 
 		 1043 aa  897    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2009  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  48 
 
 		 1041 aa  904    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0269291  normal  0.0260573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2430  acriflavin resistance protein  52.33 
 
 		 1030 aa  992    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157087  normal  0.957896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2570  acriflavin resistance protein  49.71 
 
 		 1041 aa  928    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2571  acriflavin resistance protein  44.66 
 
 		 1037 aa  790    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0468972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  44.9 
 
 		 1042 aa  866    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1511  acriflavin resistance protein  43.5 
 
 		 1037 aa  765    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1512  acriflavin resistance protein  45.98 
 
 		 1042 aa  810    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.901552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1509  acriflavin resistance protein  51.08 
 
 		 1048 aa  1015    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2063  acriflavin resistance protein  44.41 
 
 		 1032 aa  823    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2064  acriflavin resistance protein  48.88 
 
 		 1042 aa  914    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.730897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3602  acriflavin resistance protein  45.13 
 
 		 1096 aa  856    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3603  acriflavin resistance protein  51.38 
 
 		 1037 aa  936    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0448996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0512  acriflavin resistance protein  44.67 
 
 		 1100 aa  835    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0513  acriflavin resistance protein  50.93 
 
 		 1051 aa  968    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0135048  normal  0.800803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0600  acriflavin resistance protein  50.62 
 
 		 1066 aa  976    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654802  normal  0.436006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3582  acriflavin resistance protein  43.92 
 
 		 1069 aa  836    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2830  acriflavin resistance protein  48.13 
 
 		 1092 aa  956    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2831  acriflavin resistance protein  45.92 
 
 		 1032 aa  833    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3933  multidrug resistance protein mdtB  49.27 
 
 		 1042 aa  899    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.906804 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0718  acriflavin resistance protein  50.98 
 
 		 1039 aa  936    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2686  multidrug efflux system subunit MdtC  47.11 
 
 		 1025 aa  858    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1026  acriflavin resistance protein  45.23 
 
 		 1032 aa  865    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1368  multidrug resistance protein MdtB  52.18 
 
 		 1036 aa  968    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  44.98 
 
 		 1035 aa  878    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2531  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.85 
 
 		 1048 aa  927    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3169  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.66 
 
 		 1048 aa  924    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0164478  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0765  putative multidrug efflux protein  41.05 
 
 		 1026 aa  734    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1079  acriflavin resistance protein  51.18 
 
 		 1039 aa  929    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31890  putative RND efflux transporter  51.32 
 
 		 1043 aa  949    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31900  putative efflux transporter  48.16 
 
 		 1036 aa  830    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45890  putative RND efflux transporter  71.71 
 
 		 1036 aa  1475    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.961343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2187  acriflavin resistance protein  51.12 
 
 		 1032 aa  963    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1197  acriflavin resistance protein  50.98 
 
 		 1039 aa  936    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  45.16 
 
 		 1055 aa  896    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.66 
 
 		 1048 aa  925    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2203  acriflavin resistance protein  52.06 
 
 		 1029 aa  969    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2204  acriflavin resistance protein  47.98 
 
 		 1036 aa  853    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  44.15 
 
 		 1032 aa  877    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2429  acriflavin resistance protein  45.36 
 
 		 1034 aa  796    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.618846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  46.16 
 
 		 1041 aa  885    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0133  acriflavin resistance protein  42.63 
 
 		 1030 aa  735    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2040  acriflavin resistance protein  44.58 
 
 		 1070 aa  802    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2592  acriflavin resistance protein  46.48 
 
 		 1108 aa  848    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.616304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2593  acriflavin resistance protein  46.25 
 
 		 1072 aa  882    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2145  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.66 
 
 		 1048 aa  925    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.536412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0345  acriflavin resistance protein  52.28 
 
 		 1051 aa  1028    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2287  acriflavin resistance protein  49.32 
 
 		 1026 aa  862    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362502  normal  0.921003 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2288  acriflavin resistance protein  42.9 
 
 		 1089 aa  696    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0721362  normal  0.38307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>