223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3354 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  50.21 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  51.68 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2552  Smr protein/MutS2-like  51.26 
 
 		 242 aa  190  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049818  hitchhiker  0.000000000032251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  46.44 
 
 		 239 aa  168  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  47.75 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  48.2 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  39.92 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  37.5 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  35.23 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  32.98 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  36.02 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  41.96 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  41.96 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  30.37 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  45.92 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  32.46 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  45.1 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  37.1 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  30.37 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  29.32 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  32.46 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  32.46 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  32.46 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  39.84 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  32.98 
 
 		 450 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  39.84 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  42.72 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  38.53 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  51.16 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  36.22 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  38.89 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  36.36 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  39.34 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  31.94 
 
 		 196 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  31.16 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  39.37 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  39.34 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  28.8 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  36.08 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  42.16 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  41.9 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  45.45 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  30.29 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  37.4 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  42.86 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  31.12 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  28.99 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  41.51 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  42.57 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  40.4 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  40.46 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  42.86 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  35.05 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  42.72 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  42.86 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  32.38 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  44.12 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  34.95 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1444  Smr protein/MutS2  28.28 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  28.95 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  44.12 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  30.69 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  34.78 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  43.14 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  35.64 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  38.39 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  35.23 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  38.39 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  40.82 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  36.13 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  36.13 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0971  hypothetical protein  27.78 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0507047  hitchhiker  0.00239069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  39.22 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  36.13 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  39.8 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  40.18 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  39.8 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  41.23 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  39.8 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  39.81 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  36.13 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  39.8 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  39.42 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  36.13 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  36.13 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  36.13 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  35.35 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  43 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  29.1 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  32.29 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  37.37 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  32.64 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  40.37 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  39.39 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  39.6 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2054  Smr protein/MutS2  31.25 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  41.82 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>