204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2643 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  53.88 
 
 		 248 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  50.44 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  51.56 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  47.44 
 
 		 254 aa  221  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  48.32 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  48.74 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  34.45 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  31.58 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004395  probable component of the lipoprotein assembly complex (forms a complex with YaeT YfgL and NlpB)  30.63 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  31.42 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  31.16 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01004  hypothetical protein  31.34 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  31.68 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.89 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0400  putative lipoprotein  32.12 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1201  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.62 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00280103  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  27.39 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.44 
 
 		 276 aa  95.1  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1139  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.72 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992241  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  27.39 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 253 aa  91.7  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.31 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.31 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  29.38 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.31 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.05 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.32 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.98 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  24.9 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0237  putative lipoprotein  27.88 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.558058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 293 aa  89  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.03 
 
 		 391 aa  88.6  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.85 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.54 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.85 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.85 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.54 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.85 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.73 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2004  putative transmembrane protein  28.91 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.519821  normal  0.271041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  25.88 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.88 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.88 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.88 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.85 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.88 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.88 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  25.88 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.88 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.88 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  27.08 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0883  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.03 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.192303  normal  0.0728426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  28.08 
 
 		 268 aa  85.5  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.74 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  27.84 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  26.07 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.52 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  26.38 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.7 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  28.08 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  28.08 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  25.53 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  25.64 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  26.09 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  29.17 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.02 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  27.04 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.02 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.19 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  24.78 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  28.19 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  25.64 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  25.3 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  26.7 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.7 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.59 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  25.11 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  23.92 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0663  outer membrane protein  26.21 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000502796  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.26 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  27.51 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  28.08 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  26.24 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3144  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  26.47 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  28.83 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  26.73 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  25.57 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.64 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  27.98 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  25.81 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  25.45 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  25.73 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4485  putative transmembrane protein  25.35 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>