236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1990 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1990  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  825    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660966  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  69.21 
 
 		 413 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1872  putative soluble aldose sugar dehydrogenase  50.25 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413591  normal  0.509919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4543  glucose sorbosone dehydrogenase  40.16 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.65 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  33.57 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  32.68 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  32.65 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0139  hypothetical protein  31.41 
 
 		 382 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  28.22 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  30.5 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.76 
 
 		 412 aa  139  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2041  glucose sorbosone dehydrogenase  31.18 
 
 		 387 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  31.63 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  29.16 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  31.15 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  30.87 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  31.79 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  30.71 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  31.98 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  33.01 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  31.99 
 
 		 413 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  28.47 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  28.85 
 
 		 395 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  32.31 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  30.03 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  30.03 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  33.06 
 
 		 399 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  31.78 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  32.97 
 
 		 389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  30.49 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  31.59 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  32.03 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  30.68 
 
 		 375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  31.66 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  32.7 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  31.74 
 
 		 378 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  28.61 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  29.14 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  30.12 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  30.98 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  28.47 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.05 
 
 		 809 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  38.33 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  32.1 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  29.84 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  27.97 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  30.41 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  30.4 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  31.13 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  31.67 
 
 		 357 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  32.08 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  25.06 
 
 		 392 aa  123  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  29.78 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  37.45 
 
 		 381 aa  123  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  29.67 
 
 		 387 aa  123  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  29.17 
 
 		 410 aa  122  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  29.85 
 
 		 396 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.55 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  33.7 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2526  glucose sorbosone dehydrogenase  31 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000347403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  36.55 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  29.4 
 
 		 378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  29.11 
 
 		 387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  28.5 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  38.79 
 
 		 343 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  31.32 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  38.03 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.12 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2752  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.09 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  31.15 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  27.3 
 
 		 466 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  29.23 
 
 		 367 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  28.26 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  27.98 
 
 		 407 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  37.35 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  30.73 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  31.15 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  27.64 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  37.8 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  28.01 
 
 		 365 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  30.05 
 
 		 405 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  29.41 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  30.6 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  30.03 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  29.43 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  27.81 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  27.09 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  31.52 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  36.48 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  26.85 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  28.76 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.68 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  31.51 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  31.65 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  27.69 
 
 		 371 aa  110  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  27.66 
 
 		 400 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  29.44 
 
 		 383 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>