291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2752 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2752  glucose/sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 435 aa  870    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  57.6 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  40.41 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  43.3 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.2 
 
 		 412 aa  260  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  42.54 
 
 		 400 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  39.81 
 
 		 400 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  42.82 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  42.27 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  43.19 
 
 		 387 aa  250  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  39.9 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  41.78 
 
 		 381 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  40.8 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  39.9 
 
 		 388 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2526  glucose sorbosone dehydrogenase  40.32 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000347403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  38.62 
 
 		 408 aa  239  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  42.33 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  40.36 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  40.81 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  40.33 
 
 		 387 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  41.42 
 
 		 387 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  39.39 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  37.82 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  41.19 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  39.13 
 
 		 428 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  40.05 
 
 		 382 aa  230  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  38.5 
 
 		 366 aa  229  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  40.43 
 
 		 381 aa  229  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  40.59 
 
 		 399 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  41.05 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  40.27 
 
 		 383 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  41.04 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  40.66 
 
 		 381 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  37.47 
 
 		 405 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  39.11 
 
 		 374 aa  226  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  39.89 
 
 		 382 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  40.66 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  36.75 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  39.68 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  39.39 
 
 		 418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  36.41 
 
 		 392 aa  223  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  39.19 
 
 		 388 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  38.01 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  38.81 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  39.8 
 
 		 374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  35.88 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  40 
 
 		 383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  37.87 
 
 		 376 aa  220  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  40.36 
 
 		 391 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  40.21 
 
 		 374 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  39.52 
 
 		 377 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  39.3 
 
 		 403 aa  219  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  39.95 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  40 
 
 		 465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  38.07 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  40.88 
 
 		 369 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  39.14 
 
 		 373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  33.26 
 
 		 407 aa  216  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  37.98 
 
 		 371 aa  216  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  37.89 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  37.98 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  38.54 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  38.06 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  37.98 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  37.98 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  40.06 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  37.98 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  37.89 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  38.81 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  40.61 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  37.67 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  37.73 
 
 		 371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  36.26 
 
 		 411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  36.25 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  38.9 
 
 		 383 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  37.41 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  37.03 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  35.96 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  36.22 
 
 		 376 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1619  glucose sorbosone dehydrogenase  37.86 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  37.82 
 
 		 466 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12328  hypothetical protein  37.06 
 
 		 392 aa  209  8e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  36.5 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  37.3 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  37.67 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  37.3 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  36.02 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  35.64 
 
 		 382 aa  203  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  33.62 
 
 		 405 aa  203  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  39.06 
 
 		 384 aa  202  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  37.17 
 
 		 386 aa  200  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  36.9 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2626  glucose sorbosone dehydrogenase  36.06 
 
 		 369 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.393801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  37.25 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  40.16 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  36.51 
 
 		 394 aa  196  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  35.77 
 
 		 395 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  35.5 
 
 		 395 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  37.64 
 
 		 377 aa  192  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  36.92 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>