241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1232 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  33.36 
 
 
1758 aa  666    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  34.4 
 
 
1738 aa  702    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  36.29 
 
 
1538 aa  736    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  67.55 
 
 
1366 aa  1880    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  32.86 
 
 
2110 aa  658    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  45.9 
 
 
1318 aa  1187    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  33.33 
 
 
2168 aa  662    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  33.7 
 
 
1551 aa  715    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  36.25 
 
 
1812 aa  735    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  100 
 
 
1340 aa  2762    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  65.51 
 
 
1323 aa  1779    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  35.16 
 
 
1727 aa  688    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  32.64 
 
 
1579 aa  643    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  32.55 
 
 
1336 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.07 
 
 
1504 aa  596  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  33.09 
 
 
1300 aa  536  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  31.17 
 
 
1281 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  31.05 
 
 
1281 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  29.65 
 
 
1193 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  28.86 
 
 
1213 aa  466  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  30.65 
 
 
1192 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  28.57 
 
 
1205 aa  463  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  29.35 
 
 
1270 aa  458  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  28.52 
 
 
1206 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.98 
 
 
1152 aa  454  1.0000000000000001e-126  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  29.29 
 
 
1207 aa  453  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  28.98 
 
 
1198 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  30.29 
 
 
1243 aa  452  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  28.98 
 
 
1198 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  28.9 
 
 
1198 aa  450  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  28.33 
 
 
1229 aa  445  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  28.4 
 
 
1209 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  27.81 
 
 
1253 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  27.06 
 
 
1263 aa  433  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  28.57 
 
 
1194 aa  435  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  28.71 
 
 
1212 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0118  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.12 
 
 
1441 aa  430  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  28.36 
 
 
1203 aa  428  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27480  CobN/magnesium chelatase family protein  32.39 
 
 
1457 aa  427  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.231054  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  29.81 
 
 
1234 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  29.77 
 
 
1187 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  29.77 
 
 
1187 aa  416  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  29.79 
 
 
1194 aa  415  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  29.51 
 
 
1249 aa  416  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  30.73 
 
 
1247 aa  413  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  40.62 
 
 
1442 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  29.06 
 
 
1197 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  29.69 
 
 
1248 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  29.46 
 
 
1248 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  28.6 
 
 
1242 aa  399  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  29.33 
 
 
1241 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  27.98 
 
 
1242 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  30.09 
 
 
1248 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  29.7 
 
 
1173 aa  396  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  29.37 
 
 
1238 aa  393  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  29.08 
 
 
1244 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  28.4 
 
 
1250 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  27.98 
 
 
1251 aa  390  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  28.48 
 
 
1249 aa  388  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  28.89 
 
 
1238 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  29.63 
 
 
1210 aa  385  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  28.47 
 
 
1193 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  28.21 
 
 
1193 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  25.82 
 
 
1239 aa  378  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  28.12 
 
 
1193 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.38 
 
 
1220 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4082  magnesium chelatase, H subunit  27.54 
 
 
1246 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1022  Cobaltochelatase  29.29 
 
 
1250 aa  371  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.550744  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.85 
 
 
2065 aa  373  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  27 
 
 
1250 aa  373  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4121  magnesium chelatase, H subunit  27.54 
 
 
1246 aa  373  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  28.37 
 
 
1104 aa  370  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0866  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.06 
 
 
1248 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587093  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4108  magnesium chelatase, H subunit  26.51 
 
 
1236 aa  362  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3620  magnesium chelatase subunit H  26.77 
 
 
1242 aa  360  9.999999999999999e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557484  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  27.84 
 
 
1175 aa  358  5e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2632  magnesium chelatase, H subunit  27.43 
 
 
1233 aa  354  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3268  cobaltochelatase, CobN subunit  27.46 
 
 
1115 aa  352  4e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0228816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  27.26 
 
 
1283 aa  350  9e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  36.92 
 
 
1800 aa  343  2e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1795  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.95 
 
 
2113 aa  341  5.9999999999999996e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  36.51 
 
 
1801 aa  338  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.22 
 
 
1750 aa  337  7.999999999999999e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1553  CobN/magnesium chelatase family protein  37.5 
 
 
1469 aa  335  4e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  26.56 
 
 
1479 aa  332  3e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49527  predicted protein  27.17 
 
 
1270 aa  332  3e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000228859  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0753  Cobaltochelatase  34.69 
 
 
1413 aa  322  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2210  cobaltochelatase subunit CobN  27.58 
 
 
1081 aa  315  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2931  cobaltochelatase subunit CobN  27.56 
 
 
1090 aa  308  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347121  hitchhiker  0.00673529 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2532  cobaltochelatase subunit CobN  27.74 
 
 
1056 aa  304  9e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310665  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1889  cobaltochelatase subunit CobN  27.03 
 
 
1108 aa  299  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62162  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3115  cobaltochelatase subunit CobN  27.93 
 
 
1109 aa  291  8e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480802  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  31.14 
 
 
1258 aa  289  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  28.79 
 
 
1244 aa  288  5e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3286  cobaltochelatase subunit CobN  26.92 
 
 
1126 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201105  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  29.86 
 
 
1259 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3144  cobaltochelatase subunit CobN  28.37 
 
 
1140 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  30.48 
 
 
1298 aa  285  4.0000000000000003e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2438  cobaltochelatase subunit CobN  28.75 
 
 
1099 aa  284  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.621018  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0342  cobaltochelatase subunit CobN  27.21 
 
 
1094 aa  283  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>