243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2438 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2438  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 		 1099 aa  2085    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.621018  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3268  cobaltochelatase, CobN subunit  46.81 
 
 		 1115 aa  873    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0228816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3115  cobaltochelatase subunit CobN  70.8 
 
 		 1109 aa  1328    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1439  cobaltochelatase subunit CobN  68.71 
 
 		 1143 aa  1319    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.293615  normal  0.816429 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2827  cobaltochelatase subunit CobN  45.66 
 
 		 1078 aa  712    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2149  cobaltochelatase subunit CobN  82.48 
 
 		 1103 aa  1526    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304993  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  47.94 
 
 		 1104 aa  886    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0342  cobaltochelatase subunit CobN  45.45 
 
 		 1094 aa  724    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1436  cobaltochelatase subunit CobN  69.82 
 
 		 1144 aa  1325    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11738  normal  0.80922 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2931  cobaltochelatase subunit CobN  42.55 
 
 		 1090 aa  731    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347121  hitchhiker  0.00673529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1889  cobaltochelatase subunit CobN  46.89 
 
 		 1108 aa  807    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1714  cobaltochelatase subunit CobN  68.77 
 
 		 1143 aa  1314    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185329  decreased coverage  0.00608846 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2210  cobaltochelatase subunit CobN  43.37 
 
 		 1081 aa  730    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1518  cobaltochelatase subunit CobN  45.56 
 
 		 1078 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0624953  normal  0.136834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3144  cobaltochelatase subunit CobN  51.28 
 
 		 1140 aa  905    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2532  cobaltochelatase subunit CobN  44.7 
 
 		 1056 aa  724    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3286  cobaltochelatase subunit CobN  52.03 
 
 		 1126 aa  850    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201105  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1468  cobaltochelatase subunit CobN  45.66 
 
 		 1078 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  41.99 
 
 		 1273 aa  476  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  42.08 
 
 		 1263 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  41.6 
 
 		 1263 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  41.94 
 
 		 1263 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  43.74 
 
 		 1240 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  40.83 
 
 		 1253 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  40.78 
 
 		 1253 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  40.53 
 
 		 1253 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  40.68 
 
 		 1260 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  40.59 
 
 		 1253 aa  446  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  40.95 
 
 		 1235 aa  444  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  42.88 
 
 		 1249 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  40.22 
 
 		 1248 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  42.74 
 
 		 1247 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  39.2 
 
 		 1254 aa  436  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  39.2 
 
 		 1254 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  42.17 
 
 		 1286 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  41.6 
 
 		 1248 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  41.24 
 
 		 1270 aa  429  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  40.4 
 
 		 1267 aa  429  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  40.84 
 
 		 1269 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  41.24 
 
 		 1270 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  40.84 
 
 		 1269 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  39.87 
 
 		 1269 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  40.51 
 
 		 1269 aa  426  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  40.43 
 
 		 1269 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  41.07 
 
 		 1281 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  41.07 
 
 		 1281 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  41.07 
 
 		 1281 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.48 
 
 		 1152 aa  419  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  40.76 
 
 		 1248 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  38.52 
 
 		 1388 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  38.81 
 
 		 1257 aa  416  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  39.51 
 
 		 1267 aa  415  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  41.11 
 
 		 1269 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  40.71 
 
 		 1273 aa  409  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  40.32 
 
 		 1278 aa  406  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  35.37 
 
 		 1288 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  32.03 
 
 		 1253 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  29.69 
 
 		 1192 aa  382  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  34.37 
 
 		 1290 aa  379  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  34.41 
 
 		 1261 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  35.75 
 
 		 1293 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  33.81 
 
 		 1247 aa  367  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  34.05 
 
 		 1247 aa  365  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  35.79 
 
 		 1263 aa  356  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2900  cobaltochelatase, CobN subunit  36.14 
 
 		 1348 aa  350  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  27.97 
 
 		 1340 aa  350  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  34.55 
 
 		 1259 aa  349  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  27.12 
 
 		 1323 aa  343  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  42.06 
 
 		 1330 aa  342  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  35.36 
 
 		 1256 aa  342  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  27.76 
 
 		 1366 aa  341  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  25.54 
 
 		 1318 aa  337  7e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.51 
 
 		 1242 aa  333  1e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.250832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  32.83 
 
 		 1435 aa  332  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  28.21 
 
 		 1245 aa  331  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  27.67 
 
 		 1245 aa  325  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  32.19 
 
 		 1363 aa  325  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  34.91 
 
 		 1453 aa  322  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  27.93 
 
 		 1245 aa  321  6e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0921  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.87 
 
 		 1245 aa  319  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.308916  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  28.17 
 
 		 1253 aa  318  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  36.97 
 
 		 1237 aa  318  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  35.56 
 
 		 1409 aa  317  7e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  34.74 
 
 		 1406 aa  310  9e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  34.53 
 
 		 1205 aa  307  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  42.5 
 
 		 1220 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  42.5 
 
 		 1220 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  42.5 
 
 		 1220 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  42.5 
 
 		 1220 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  38.24 
 
 		 1264 aa  303  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  36.54 
 
 		 1238 aa  300  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  34.07 
 
 		 1444 aa  300  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  34.18 
 
 		 1194 aa  294  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  36.92 
 
 		 1222 aa  293  9e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  34.76 
 
 		 1213 aa  293  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  36.35 
 
 		 1191 aa  293  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1940  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.62 
 
 		 1220 aa  291  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  35.75 
 
 		 1262 aa  291  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.75 
 
 		 1262 aa  291  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  30.6 
 
 		 1234 aa  290  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>