243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1518 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  45.77 
 
 		 1104 aa  850    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2827  cobaltochelatase subunit CobN  95.91 
 
 		 1078 aa  1889    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3268  cobaltochelatase, CobN subunit  44.44 
 
 		 1115 aa  815    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0228816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3144  cobaltochelatase subunit CobN  44.83 
 
 		 1140 aa  783    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0342  cobaltochelatase subunit CobN  62.87 
 
 		 1094 aa  1174    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2149  cobaltochelatase subunit CobN  44.95 
 
 		 1103 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304993  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2931  cobaltochelatase subunit CobN  63.18 
 
 		 1090 aa  1269    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347121  hitchhiker  0.00673529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1889  cobaltochelatase subunit CobN  56.26 
 
 		 1108 aa  1064    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2210  cobaltochelatase subunit CobN  70.96 
 
 		 1081 aa  1407    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2438  cobaltochelatase subunit CobN  46.29 
 
 		 1099 aa  657    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.621018  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3286  cobaltochelatase subunit CobN  47.92 
 
 		 1126 aa  789    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201105  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1439  cobaltochelatase subunit CobN  42.77 
 
 		 1143 aa  672    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.293615  normal  0.816429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1436  cobaltochelatase subunit CobN  42.41 
 
 		 1144 aa  685    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11738  normal  0.80922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3115  cobaltochelatase subunit CobN  44.66 
 
 		 1109 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1518  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 		 1078 aa  2106    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0624953  normal  0.136834 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2532  cobaltochelatase subunit CobN  68.37 
 
 		 1056 aa  1335    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1468  cobaltochelatase subunit CobN  95.73 
 
 		 1078 aa  1885    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1714  cobaltochelatase subunit CobN  42.77 
 
 		 1143 aa  664    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185329  decreased coverage  0.00608846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  38.46 
 
 		 1260 aa  439  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  38.57 
 
 		 1263 aa  430  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  38.43 
 
 		 1263 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  38.3 
 
 		 1263 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  39.32 
 
 		 1273 aa  422  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  38.95 
 
 		 1267 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  40.94 
 
 		 1240 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  38.15 
 
 		 1254 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  37.25 
 
 		 1273 aa  412  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  39.28 
 
 		 1247 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  38.19 
 
 		 1257 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  39.12 
 
 		 1269 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  39.12 
 
 		 1269 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  38.03 
 
 		 1270 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  39.12 
 
 		 1269 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  38.79 
 
 		 1286 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  37.31 
 
 		 1254 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  38.13 
 
 		 1270 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  34.94 
 
 		 1288 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  38.65 
 
 		 1269 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  37.07 
 
 		 1269 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  37.45 
 
 		 1267 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  36.9 
 
 		 1235 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  38.43 
 
 		 1269 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  38.65 
 
 		 1249 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  37.93 
 
 		 1253 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.46 
 
 		 1152 aa  393  1e-107  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  37.78 
 
 		 1253 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  38.01 
 
 		 1248 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  36.24 
 
 		 1253 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  37.54 
 
 		 1253 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  38.4 
 
 		 1281 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  38.4 
 
 		 1281 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  38.4 
 
 		 1281 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  33.8 
 
 		 1290 aa  383  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  37.72 
 
 		 1278 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  38.56 
 
 		 1248 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  36.22 
 
 		 1263 aa  376  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  33.67 
 
 		 1261 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  33.92 
 
 		 1247 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2900  cobaltochelatase, CobN subunit  37.65 
 
 		 1348 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  33.77 
 
 		 1247 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  38.42 
 
 		 1248 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  34.84 
 
 		 1293 aa  365  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  45.16 
 
 		 1388 aa  351  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  40.92 
 
 		 1330 aa  349  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  29.59 
 
 		 1192 aa  346  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  31.91 
 
 		 1363 aa  335  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  25.19 
 
 		 1229 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  29.71 
 
 		 1253 aa  318  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  27.45 
 
 		 1323 aa  307  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  42.64 
 
 		 1220 aa  304  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  42.64 
 
 		 1220 aa  304  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  42.64 
 
 		 1220 aa  304  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  42.39 
 
 		 1220 aa  301  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  33.86 
 
 		 1237 aa  300  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.67 
 
 		 1242 aa  296  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.250832 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  26.91 
 
 		 1340 aa  293  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  27.69 
 
 		 1366 aa  291  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  33.62 
 
 		 1256 aa  290  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.61 
 
 		 1259 aa  289  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  37.05 
 
 		 1238 aa  288  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  26.43 
 
 		 1318 aa  288  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  35.17 
 
 		 1264 aa  287  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  26.37 
 
 		 1249 aa  283  9e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  38.86 
 
 		 1205 aa  283  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  36.12 
 
 		 1262 aa  283  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.65 
 
 		 1262 aa  281  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  41.4 
 
 		 1196 aa  280  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  41.09 
 
 		 1207 aa  279  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  31.74 
 
 		 1453 aa  279  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  32.37 
 
 		 1406 aa  278  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  35.05 
 
 		 1266 aa  277  7e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  28 
 
 		 1194 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  40.58 
 
 		 1222 aa  276  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  26.92 
 
 		 1245 aa  276  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  32.58 
 
 		 1245 aa  275  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  30.22 
 
 		 1435 aa  275  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  27.15 
 
 		 1248 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0626  cobalamin biosynthesis protein  38.63 
 
 		 1379 aa  274  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.941257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  30.63 
 
 		 1426 aa  274  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  28.69 
 
 		 1197 aa  274  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>