243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2149 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2149  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 
1103 aa  2117    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304993  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3268  cobaltochelatase, CobN subunit  45.49 
 
 
1115 aa  844    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0228816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1518  cobaltochelatase subunit CobN  44.74 
 
 
1078 aa  720    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0624953  normal  0.136834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1714  cobaltochelatase subunit CobN  68.67 
 
 
1143 aa  1318    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185329  decreased coverage  0.00608846 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2827  cobaltochelatase subunit CobN  45.26 
 
 
1078 aa  716    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3507  cobaltochelatase, CobN subunit  46.85 
 
 
1104 aa  871    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11583  normal  0.546877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0342  cobaltochelatase subunit CobN  45.29 
 
 
1094 aa  719    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2438  cobaltochelatase subunit CobN  82.26 
 
 
1099 aa  1489    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.621018  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2931  cobaltochelatase subunit CobN  42.15 
 
 
1090 aa  719    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347121  hitchhiker  0.00673529 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1436  cobaltochelatase subunit CobN  69.11 
 
 
1144 aa  1346    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11738  normal  0.80922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1889  cobaltochelatase subunit CobN  46.51 
 
 
1108 aa  803    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62162  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3115  cobaltochelatase subunit CobN  69.38 
 
 
1109 aa  1302    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480802  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2210  cobaltochelatase subunit CobN  43.49 
 
 
1081 aa  726    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3286  cobaltochelatase subunit CobN  51.16 
 
 
1126 aa  819    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201105  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1439  cobaltochelatase subunit CobN  68.41 
 
 
1143 aa  1330    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.293615  normal  0.816429 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2532  cobaltochelatase subunit CobN  43.55 
 
 
1056 aa  695    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310665  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3144  cobaltochelatase subunit CobN  50.8 
 
 
1140 aa  904    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1468  cobaltochelatase subunit CobN  45.44 
 
 
1078 aa  717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428547  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  41.6 
 
 
1263 aa  458  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  41.04 
 
 
1263 aa  458  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  41.46 
 
 
1263 aa  456  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  40.14 
 
 
1273 aa  453  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  40.2 
 
 
1260 aa  449  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  42.84 
 
 
1247 aa  446  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  40.66 
 
 
1248 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  41.34 
 
 
1286 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  41.9 
 
 
1249 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  40 
 
 
1253 aa  433  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  39.31 
 
 
1254 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  40 
 
 
1253 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  39.72 
 
 
1253 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  41.32 
 
 
1240 aa  422  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  38.71 
 
 
1254 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  39.26 
 
 
1253 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  39.34 
 
 
1235 aa  418  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  40.25 
 
 
1248 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  39.28 
 
 
1269 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  39.65 
 
 
1269 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  39.66 
 
 
1270 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  38.63 
 
 
1257 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.02 
 
 
1152 aa  403  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  38.54 
 
 
1267 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  38.99 
 
 
1269 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  39.66 
 
 
1270 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  38.99 
 
 
1269 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  39.55 
 
 
1281 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  37.07 
 
 
1269 aa  399  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  39.53 
 
 
1248 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  39.55 
 
 
1281 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  39.37 
 
 
1281 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  38.58 
 
 
1267 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  39.73 
 
 
1269 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  34.92 
 
 
1247 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  38.84 
 
 
1273 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  35.06 
 
 
1247 aa  386  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  38.76 
 
 
1278 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  34.71 
 
 
1288 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  34.09 
 
 
1290 aa  376  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  36.64 
 
 
1330 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  30.11 
 
 
1192 aa  375  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  34.97 
 
 
1293 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  34.04 
 
 
1261 aa  373  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  31.37 
 
 
1253 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  39.8 
 
 
1388 aa  357  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  34.72 
 
 
1263 aa  351  5e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2900  cobaltochelatase, CobN subunit  34.68 
 
 
1348 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241164  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  23.83 
 
 
1229 aa  344  5e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  33.15 
 
 
1363 aa  344  5e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  34.84 
 
 
1256 aa  343  2e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  26.67 
 
 
1318 aa  341  5e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  27.54 
 
 
1323 aa  335  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  27.21 
 
 
1340 aa  333  9e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.54 
 
 
1242 aa  329  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.250832 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  26.31 
 
 
1551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  27.18 
 
 
1538 aa  328  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  33.86 
 
 
1259 aa  324  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  32.25 
 
 
1234 aa  322  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  27.21 
 
 
1366 aa  321  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  28.48 
 
 
1243 aa  320  9e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  29.41 
 
 
1210 aa  318  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  28.59 
 
 
1253 aa  316  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  31.07 
 
 
1435 aa  316  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  27.44 
 
 
1245 aa  315  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  26.05 
 
 
1245 aa  315  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  35.98 
 
 
1237 aa  314  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  27.16 
 
 
1245 aa  310  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0921  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.99 
 
 
1245 aa  308  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.308916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  34.11 
 
 
1406 aa  307  7e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  34.07 
 
 
1409 aa  305  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  26.73 
 
 
1812 aa  302  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  42.4 
 
 
1220 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  42.4 
 
 
1220 aa  302  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  42.4 
 
 
1220 aa  302  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  34.02 
 
 
1453 aa  301  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  42.4 
 
 
1220 aa  302  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  35.32 
 
 
1262 aa  297  6e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.41 
 
 
1262 aa  296  1e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  32.96 
 
 
1194 aa  295  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  32.83 
 
 
1444 aa  292  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  35.06 
 
 
1191 aa  290  9e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>