More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0432 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 305 aa  623  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  83.5 
 
 		 305 aa  534  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  77.56 
 
 		 313 aa  500  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  77.23 
 
 		 305 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  74.26 
 
 		 304 aa  485  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  72.46 
 
 		 305 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  71.8 
 
 		 305 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  62.25 
 
 		 313 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  61.18 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  61.59 
 
 		 314 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  61.18 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  53.85 
 
 		 303 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  53.18 
 
 		 303 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  53.51 
 
 		 303 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  52.15 
 
 		 303 aa  351  8e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  52.84 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  52.17 
 
 		 303 aa  345  7e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  51.51 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  52.33 
 
 		 307 aa  330  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  52.16 
 
 		 312 aa  326  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  51.97 
 
 		 318 aa  322  7e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  50.81 
 
 		 308 aa  318  9e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  50.33 
 
 		 307 aa  317  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  50.99 
 
 		 306 aa  315  7e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  49.33 
 
 		 308 aa  308  5e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  48.34 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  49.83 
 
 		 304 aa  305  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  49.34 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  47.52 
 
 		 308 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  49.01 
 
 		 306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  48.03 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  41.75 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  41.64 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.89 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  23.51 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  23.96 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  33.59 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  26.04 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26.38 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  23.82 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  29.48 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  26.95 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  27.13 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  27.91 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  29.41 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  24.92 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  35.94 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  22.88 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  24.73 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.51 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.51 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  27.24 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  25.62 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.51 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  25.62 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.51 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.51 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  23.32 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  26.46 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  38.55 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  37.63 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  38.55 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  26.18 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  28.57 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  27.52 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  25.53 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  26.46 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  28.22 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.67 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  24.81 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  35.19 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  24.81 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  24.81 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  24.81 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  24.81 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  24.12 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  27.67 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  26.9 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  26.86 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  36.47 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  25.42 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  30.08 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3037  PfkB domain protein  25.27 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  38.04 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  27.08 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  35.16 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  25.8 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  35.09 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  35.4 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  25.65 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  22.63 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  40.91 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  40.74 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  34.07 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  26.94 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  29.93 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  26.44 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  24.69 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>