More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0369 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  53.02 
 
 		 596 aa  675    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  57.72 
 
 		 598 aa  710    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 596 aa  1214    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  45.23 
 
 		 595 aa  519  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  40 
 
 		 581 aa  488  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  40.66 
 
 		 596 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  41.39 
 
 		 589 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  40.88 
 
 		 589 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  40.56 
 
 		 604 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  39.25 
 
 		 576 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  37.37 
 
 		 574 aa  382  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  34.31 
 
 		 565 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  34.32 
 
 		 599 aa  359  8e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  25.61 
 
 		 545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  25.61 
 
 		 545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  26.79 
 
 		 589 aa  150  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  26.54 
 
 		 593 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  27.51 
 
 		 610 aa  142  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  23.06 
 
 		 641 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  26.31 
 
 		 578 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  26.34 
 
 		 602 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  21.68 
 
 		 592 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  32.77 
 
 		 248 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  25.42 
 
 		 599 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  25.67 
 
 		 594 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 589 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  25.58 
 
 		 587 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  26.24 
 
 		 606 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  32.51 
 
 		 239 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  30.93 
 
 		 218 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  26.28 
 
 		 348 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  28.5 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  23.38 
 
 		 499 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  26.4 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  24.28 
 
 		 614 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  28.49 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  22.94 
 
 		 617 aa  77.8  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  30.11 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  28.64 
 
 		 612 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  24.23 
 
 		 661 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  23.97 
 
 		 661 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  27.38 
 
 		 611 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  24.3 
 
 		 661 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  26.05 
 
 		 576 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  23.71 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  23.71 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  23.71 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  23.71 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  23.64 
 
 		 652 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  29.57 
 
 		 618 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  22.32 
 
 		 615 aa  73.9  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  25.21 
 
 		 226 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  27.42 
 
 		 722 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  23.26 
 
 		 605 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  23.71 
 
 		 661 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  24.86 
 
 		 616 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  23.06 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  28.25 
 
 		 753 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  45.9 
 
 		 1048 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  28.34 
 
 		 602 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  45.9 
 
 		 1057 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  24.16 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  22.19 
 
 		 618 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  45.9 
 
 		 930 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  45.9 
 
 		 858 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  45.9 
 
 		 872 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  45.9 
 
 		 896 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  26.1 
 
 		 668 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  21.63 
 
 		 669 aa  67  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  23.91 
 
 		 794 aa  66.6  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  36.99 
 
 		 874 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  44.12 
 
 		 613 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  27.31 
 
 		 794 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  21.67 
 
 		 360 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  36.99 
 
 		 916 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  36.99 
 
 		 922 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  27.31 
 
 		 778 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  26.4 
 
 		 692 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  42.65 
 
 		 618 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  26.42 
 
 		 735 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  25.41 
 
 		 782 aa  65.1  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3254  vgrG protein  21.26 
 
 		 710 aa  64.3  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  40.28 
 
 		 730 aa  64.3  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  25.75 
 
 		 722 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  26.92 
 
 		 722 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  24.73 
 
 		 687 aa  63.9  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  25 
 
 		 644 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  33.61 
 
 		 774 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  22.76 
 
 		 769 aa  63.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  30.23 
 
 		 726 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  25.11 
 
 		 683 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  26.96 
 
 		 668 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  25.76 
 
 		 790 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  30.25 
 
 		 725 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  33.61 
 
 		 907 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  30.06 
 
 		 697 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  28.44 
 
 		 771 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  26.97 
 
 		 245 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  33.61 
 
 		 756 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>