More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1006 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1006  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
382 aa  791    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1818  glycosyl transferase, group 1  72.44 
 
 
382 aa  600  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1382  glycosyltransferase-like protein  60.69 
 
 
387 aa  487  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.702037  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2879  glycosyl transferase group 1  37.78 
 
 
385 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.658622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2971  glycosyl transferase group 1  36.97 
 
 
391 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.176769  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  33.93 
 
 
420 aa  129  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
407 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
419 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6548  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
405 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6549  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
427 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
386 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
391 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.9 
 
 
411 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3374  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0766435  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0364  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.55 
 
 
412 aa  86.3  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  33.15 
 
 
383 aa  86.3  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
385 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
347 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  25.96 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6301  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  29.41 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
360 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.35 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  27.67 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  28.16 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  31.25 
 
 
423 aa  69.7  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  26.85 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1603  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  28.16 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.29 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
355 aa  69.3  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
346 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3517  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  27.68 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05710  glycosyltransferase  29.73 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0868  a-glycosyltransferase  28.43 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0630159 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  31.29 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
471 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0791  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  32.05 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 
398 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  27.01 
 
 
513 aa  67  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  30.27 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4365  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
422 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.893788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
382 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
462 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
389 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>