93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0747 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0747  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 208 aa  431  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.340191  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  36.32 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3204  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.35 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0883  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.35 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2031  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.35 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231053  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2717  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.35 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.78 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  35.78 
 
 		 723 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3188  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  35.35 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1893  thioredoxin domain-containing protein  35.35 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389151  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2418  DSBA oxidoreductase  34.33 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0716  DSBA oxidoreductase  37 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.759492  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0733  DSBA oxidoreductase  37 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3929  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 		 212 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559828  normal  0.0117415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  34.31 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0837  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 212 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2547  DSBA oxidoreductase  34 
 
 		 212 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.435599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0809  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 212 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0353  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 212 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.824557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  31.92 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 229 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  33.82 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  32.06 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  31.88 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03849  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07870)  32 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.728654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  27.66 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  28.04 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  26.6 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  29.32 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  27.51 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  24.12 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  27.66 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  26.6 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  23.08 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  24.12 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  23.62 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  24.49 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  25.5 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  26.63 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  27.23 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  28.19 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  24.62 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  25.52 
 
 		 204 aa  42  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 		 232 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  25.91 
 
 		 202 aa  41.6  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  27.08 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>