More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0464 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  78.62 
 
 		 467 aa  764    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  100 
 
 		 484 aa  1002    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  37.82 
 
 		 474 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  37.82 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  38.46 
 
 		 503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  40.49 
 
 		 479 aa  126  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  39.47 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  35.61 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  37.18 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  37.25 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  41.45 
 
 		 441 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  39.87 
 
 		 741 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  35.85 
 
 		 473 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  32.32 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  37.82 
 
 		 447 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  35.85 
 
 		 475 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  35.85 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  35.85 
 
 		 472 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  37.82 
 
 		 468 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  33.85 
 
 		 388 aa  123  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  32.9 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.58 
 
 		 441 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  37.25 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  36.41 
 
 		 390 aa  121  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  38.41 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  39.87 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  35.2 
 
 		 457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  39.63 
 
 		 465 aa  120  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  30.87 
 
 		 491 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  42.11 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  45.45 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  40.13 
 
 		 385 aa  118  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  36.36 
 
 		 472 aa  118  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  40.23 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  40.23 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  39.39 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  35.45 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  36.59 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  34.67 
 
 		 437 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  34.3 
 
 		 517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  39.47 
 
 		 523 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  36.22 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  37.01 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  39.66 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  34.43 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  40.14 
 
 		 438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  38.82 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  36.6 
 
 		 430 aa  113  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  36.75 
 
 		 454 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  36.75 
 
 		 454 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  35.68 
 
 		 453 aa  113  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  37.5 
 
 		 569 aa  113  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  38.46 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  34.16 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  38.96 
 
 		 439 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  33.86 
 
 		 464 aa  110  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  53.12 
 
 		 468 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  35.37 
 
 		 380 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  35.71 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  37.25 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  38.13 
 
 		 312 aa  108  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  34.62 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  41.13 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  29.41 
 
 		 353 aa  107  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  38.71 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  34.18 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  38.71 
 
 		 499 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  32.8 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  37.5 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  51.55 
 
 		 512 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  37.5 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  51.55 
 
 		 471 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  38.71 
 
 		 425 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  31.28 
 
 		 437 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  51.55 
 
 		 472 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  33.7 
 
 		 498 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  51.55 
 
 		 509 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  48.57 
 
 		 470 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  41.18 
 
 		 419 aa  103  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  31.97 
 
 		 490 aa  103  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  38.06 
 
 		 421 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  38.06 
 
 		 421 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  38.06 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  38.06 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  33.55 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  48.96 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  44.9 
 
 		 695 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  35.33 
 
 		 345 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  41.53 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  31.82 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  32.89 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  34.42 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  38.06 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  34.55 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  36.36 
 
 		 477 aa  101  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  36.11 
 
 		 477 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  41.61 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  34.87 
 
 		 470 aa  101  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  35.71 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  31.17 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>