More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1096 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  54.96 
 
 		 931 aa  897    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  53.46 
 
 		 898 aa  900    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  74.07 
 
 		 892 aa  1339    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  63.58 
 
 		 902 aa  1135    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  53.05 
 
 		 901 aa  900    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.21 
 
 		 895 aa  642    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  100 
 
 		 899 aa  1802    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  55.53 
 
 		 917 aa  938    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  43.48 
 
 		 1072 aa  479  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  43.56 
 
 		 1078 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  44.34 
 
 		 1006 aa  477  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.22 
 
 		 1112 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  45.56 
 
 		 1074 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  44.25 
 
 		 1050 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  45.02 
 
 		 1019 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.44 
 
 		 1048 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  42.03 
 
 		 1047 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.53 
 
 		 1007 aa  459  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.9 
 
 		 1047 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  42.78 
 
 		 1033 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  44.75 
 
 		 1013 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  42.25 
 
 		 924 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  40.61 
 
 		 918 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  40.46 
 
 		 918 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  50.52 
 
 		 1028 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  40.61 
 
 		 918 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  40.46 
 
 		 918 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  45.2 
 
 		 1019 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  40.46 
 
 		 918 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  45.48 
 
 		 1040 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  39.85 
 
 		 918 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  40.46 
 
 		 918 aa  446  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  42.86 
 
 		 1007 aa  446  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.64 
 
 		 925 aa  445  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 918 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  43.69 
 
 		 990 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  39.79 
 
 		 918 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  40.92 
 
 		 1048 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.19 
 
 		 933 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  39.85 
 
 		 918 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  41.6 
 
 		 1185 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  40.85 
 
 		 980 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  39.85 
 
 		 918 aa  438  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  39.78 
 
 		 1175 aa  429  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  38.45 
 
 		 1152 aa  432  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  40.89 
 
 		 1067 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  43.49 
 
 		 1063 aa  412  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  39.74 
 
 		 958 aa  411  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  38.75 
 
 		 886 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.91 
 
 		 1029 aa  409  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  42.62 
 
 		 1065 aa  409  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.33 
 
 		 1026 aa  398  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  38.59 
 
 		 1194 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  46.62 
 
 		 1531 aa  395  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  42.11 
 
 		 1099 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  43.53 
 
 		 903 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  38.18 
 
 		 988 aa  382  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  45.12 
 
 		 621 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  40.2 
 
 		 949 aa  363  7.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  43.21 
 
 		 617 aa  348  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  39.19 
 
 		 1062 aa  336  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  35.24 
 
 		 1125 aa  332  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  40.58 
 
 		 1087 aa  331  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.06 
 
 		 1082 aa  325  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  37.4 
 
 		 1069 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.4 
 
 		 982 aa  324  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  37.4 
 
 		 1069 aa  323  6e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  38.07 
 
 		 1055 aa  323  9.000000000000001e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  42.26 
 
 		 1068 aa  320  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.22 
 
 		 1104 aa  319  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  35.32 
 
 		 1031 aa  318  3e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.08 
 
 		 1082 aa  318  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  40.2 
 
 		 1068 aa  317  5e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.53 
 
 		 1112 aa  317  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  40.51 
 
 		 1068 aa  317  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  35.63 
 
 		 1130 aa  317  5e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  39.71 
 
 		 1077 aa  317  6e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  40.35 
 
 		 876 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  38.16 
 
 		 1021 aa  315  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  35.17 
 
 		 1084 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 		 1069 aa  312  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  40.69 
 
 		 959 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.45 
 
 		 1091 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  39.96 
 
 		 1070 aa  311  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  38.62 
 
 		 1084 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  38.41 
 
 		 1084 aa  310  6.999999999999999e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  39.78 
 
 		 1003 aa  310  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  42.58 
 
 		 1108 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  39.96 
 
 		 1071 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  40.66 
 
 		 1073 aa  308  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  42.7 
 
 		 1066 aa  308  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.38 
 
 		 1139 aa  308  4.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.46 
 
 		 1068 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 		 1129 aa  307  6e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  40.04 
 
 		 1073 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  38.25 
 
 		 977 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 		 1066 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  40.38 
 
 		 1082 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  40.21 
 
 		 1082 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  40.21 
 
 		 1082 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>