More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0489 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
336 aa  669    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17750  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  56.19 
 
 
336 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274978  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.25 
 
 
338 aa  325  9e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.95 
 
 
338 aa  323  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 
343 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000546262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.13 
 
 
331 aa  290  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.594312  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
329 aa  285  5.999999999999999e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.136155  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1546  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 
329 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.201303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 
329 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.349408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.73 
 
 
331 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
325 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0911  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components  43.21 
 
 
331 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.970668  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
325 aa  255  8e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
325 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100059 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.54 
 
 
347 aa  250  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.281902  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
325 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249193  normal  0.645834 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
344 aa  245  6.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480535  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34920  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.99 
 
 
331 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949734  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.8818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
326 aa  238  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37 
 
 
328 aa  237  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2577  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  39.14 
 
 
328 aa  237  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03424  hypothetical protein  38.23 
 
 
328 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
324 aa  235  7e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.399045  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002585  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 1  38.23 
 
 
328 aa  235  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.39 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0148  peptide ABC transporter, permease protein  38.53 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
330 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
329 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.871135  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
336 aa  230  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000423079  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
328 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
325 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.480445  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20170  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.8 
 
 
325 aa  226  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
326 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28032  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7457  peptide ABC transporter, permease protein  38.44 
 
 
334 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3010  ABC transporter related  34.33 
 
 
339 aa  219  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.932121  normal  0.429089 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
337 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0158247  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
331 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
323 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0635033  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.040531  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0397671  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.181777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06400  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.26 
 
 
326 aa  212  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36653  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
326 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 
334 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
333 aa  208  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
336 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.105746  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
331 aa  203  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
334 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
334 aa  198  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
334 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406574  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
336 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.190258  normal  0.544383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
336 aa  192  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.63253  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
334 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
335 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.707865  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.403532  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
335 aa  189  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
339 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
334 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000109875  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1269  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.78 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
329 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3568  oligopeptide ABC transporter, permease  34.06 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0709186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0546  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  35.58 
 
 
324 aa  180  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000873967  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
343 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  33.43 
 
 
336 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
332 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21750  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.19 
 
 
362 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211245  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
335 aa  176  6e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000367904 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  32.32 
 
 
326 aa  175  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
344 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  30.7 
 
 
336 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1614  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35 
 
 
304 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
335 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  32.85 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  32.56 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  32.56 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.34 
 
 
336 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
317 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 
363 aa  173  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182893  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.14 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
313 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1493  peptide ABC transporter, permease protein  37.12 
 
 
324 aa  170  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
339 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.431953  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
324 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
365 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  31.69 
 
 
336 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  30.12 
 
 
336 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  31.01 
 
 
337 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
324 aa  169  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.12 
 
 
333 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19900  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.32 
 
 
348 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00317245  hitchhiker  0.000399681 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
329 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>