133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0331 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0331  flagellar basal body L-ring protein-like protein  100 
 
 
211 aa  421  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0669  flagellar basal body L-ring protein-like protein  40.22 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0165935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0844  flagellar L-ring protein  33.82 
 
 
203 aa  108  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.136014  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1252  flagellar L-ring protein  30.58 
 
 
199 aa  95.5  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1203  flagellar L-ring protein  30.58 
 
 
199 aa  95.5  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  30.29 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  29.34 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  29.34 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  29.59 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  28.99 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  31.65 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  27.6 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  28.81 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  27.42 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  29.09 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  29.75 
 
 
229 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  27.38 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  27.22 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  28.93 
 
 
230 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  31.98 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  29.71 
 
 
261 aa  58.5  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  26.35 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  26.95 
 
 
231 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  25.56 
 
 
239 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  27.39 
 
 
244 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  28.9 
 
 
234 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  31.14 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  29.65 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  26.82 
 
 
240 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  29.7 
 
 
246 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  27.61 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  30.81 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  30.59 
 
 
259 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  27.62 
 
 
232 aa  55.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 
242 aa  55.5  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  27.67 
 
 
232 aa  55.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  29.41 
 
 
231 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  27.98 
 
 
238 aa  55.1  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  29.31 
 
 
224 aa  55.1  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  30.39 
 
 
230 aa  55.1  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  27.39 
 
 
228 aa  54.7  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  30.06 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  28.75 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  30.06 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  30.23 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  28.31 
 
 
242 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  29.21 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  30.06 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  30.23 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  27.33 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  26.83 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  28.74 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  25.9 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  25.9 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  26.97 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  28.74 
 
 
344 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  37.31 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  30.23 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  37.31 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  29.71 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  31.71 
 
 
224 aa  52.4  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  30.63 
 
 
224 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  37.31 
 
 
239 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  27.44 
 
 
252 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  29.19 
 
 
240 aa  52  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 
230 aa  52.4  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  26.74 
 
 
252 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  27.27 
 
 
246 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  27.27 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  22.87 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  26.51 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  26.4 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  24.34 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  28.3 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  28.42 
 
 
230 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  25.15 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2266  flagellar L-ring protein  26.78 
 
 
201 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181453  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  29.25 
 
 
255 aa  48.5  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 
229 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  26.71 
 
 
237 aa  48.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  27.06 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  27.38 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  28.32 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  40.91 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  24.12 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  37.8 
 
 
250 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  37.8 
 
 
250 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  37.8 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  33.75 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  23.78 
 
 
234 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  34.41 
 
 
250 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  26.22 
 
 
259 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2235  flagellar L-ring protein  24.46 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  27.22 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  31.52 
 
 
221 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  39.39 
 
 
252 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  27.11 
 
 
245 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  26.16 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  36.36 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  26.39 
 
 
250 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>