183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2560 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  72.44 
 
 		 832 aa  1050    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  74.22 
 
 		 838 aa  1166    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  73.63 
 
 		 838 aa  1160    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  75.69 
 
 		 833 aa  1048    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  74.58 
 
 		 834 aa  1108    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  73.02 
 
 		 835 aa  1088    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  72.92 
 
 		 830 aa  1032    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1758  hypothetical protein  73.29 
 
 		 835 aa  1026    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293557  hitchhiker  0.00000000277599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2560  hypothetical protein  100 
 
 		 834 aa  1592    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315514  hitchhiker  0.00000000000119307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  72.17 
 
 		 832 aa  1042    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2296  hypothetical protein  72.66 
 
 		 833 aa  1030    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  44.74 
 
 		 830 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  40.05 
 
 		 829 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  38.03 
 
 		 828 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  42.39 
 
 		 831 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  38.61 
 
 		 835 aa  502  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  35.24 
 
 		 842 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  35.36 
 
 		 840 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  41.89 
 
 		 842 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  38.91 
 
 		 869 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  36.81 
 
 		 844 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  36.2 
 
 		 835 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  39.26 
 
 		 851 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  40.9 
 
 		 828 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 		 836 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  35.81 
 
 		 844 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  34.22 
 
 		 819 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  37.64 
 
 		 870 aa  446  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  39.61 
 
 		 840 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  38.14 
 
 		 844 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  38.35 
 
 		 857 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  38.31 
 
 		 871 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0684  hypothetical protein  39.63 
 
 		 829 aa  437  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.852275  normal  0.517784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  37.44 
 
 		 840 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  37.78 
 
 		 858 aa  439  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  38.05 
 
 		 863 aa  439  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  37.94 
 
 		 871 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  37.94 
 
 		 871 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  38.1 
 
 		 857 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  35.63 
 
 		 843 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  38.3 
 
 		 827 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  38.77 
 
 		 826 aa  432  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  38.33 
 
 		 853 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  37.95 
 
 		 838 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  37.6 
 
 		 871 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  38.87 
 
 		 856 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  38.6 
 
 		 874 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  36.86 
 
 		 839 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  38.15 
 
 		 871 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  37.75 
 
 		 843 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0533  hypothetical protein  38.59 
 
 		 840 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  38.25 
 
 		 834 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  37.61 
 
 		 861 aa  412  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  37.52 
 
 		 869 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  36.99 
 
 		 860 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0008  protein of unknown function DUF214  37.78 
 
 		 836 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 880 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  37.46 
 
 		 1108 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  34.34 
 
 		 821 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 		 883 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  33.82 
 
 		 832 aa  401  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  35.29 
 
 		 804 aa  399  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  34.53 
 
 		 823 aa  399  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  35.32 
 
 		 833 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  35.43 
 
 		 833 aa  389  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  35.08 
 
 		 833 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  34.93 
 
 		 804 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1487  ABC transporter, permease, putative  36 
 
 		 818 aa  382  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  34.93 
 
 		 804 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 		 804 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 		 804 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  34.81 
 
 		 804 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 		 805 aa  378  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  35.89 
 
 		 809 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 		 804 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  34.81 
 
 		 804 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2783  hypothetical protein  33.76 
 
 		 837 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.667381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 		 804 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0649  protein of unknown function DUF214  40.1 
 
 		 838 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2707  hypothetical protein  33.8 
 
 		 836 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  35.77 
 
 		 809 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  34.87 
 
 		 804 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2566  hypothetical protein  34.8 
 
 		 827 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  35.52 
 
 		 809 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2686  hypothetical protein  33.57 
 
 		 842 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  34.79 
 
 		 804 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2926  ABC transporter, permease, putative  34.64 
 
 		 835 aa  369  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  34.75 
 
 		 804 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  34.62 
 
 		 804 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2401  hypothetical protein  34.92 
 
 		 816 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.678425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  32.2 
 
 		 809 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1680  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 		 842 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.432743  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  34.62 
 
 		 804 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1662  hypothetical protein  33.29 
 
 		 817 aa  365  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000552359  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  31.79 
 
 		 809 aa  363  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2366  hypothetical protein  33.97 
 
 		 827 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.197088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2390  hypothetical protein  34.72 
 
 		 831 aa  360  7e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.652609  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2066  hypothetical protein  38.82 
 
 		 835 aa  359  9.999999999999999e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  35.53 
 
 		 810 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  31.02 
 
 		 815 aa  346  8e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>