More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0581 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 374 aa  764    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  84.1 
 
 		 373 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  81.82 
 
 		 374 aa  634    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  84.1 
 
 		 373 aa  648    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  81.02 
 
 		 374 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  80.48 
 
 		 374 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  80.21 
 
 		 374 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  80.21 
 
 		 374 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  80.05 
 
 		 373 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  79.25 
 
 		 373 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  78.44 
 
 		 373 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  50.14 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  50.67 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  50.67 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  50.4 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  50.67 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  50.67 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  51.21 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  50.27 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  51.21 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  50.54 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  50.54 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  50.54 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.09 
 
 		 374 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  50.54 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  50 
 
 		 374 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  47.57 
 
 		 377 aa  333  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  45.72 
 
 		 378 aa  322  6e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  43.8 
 
 		 391 aa  315  9e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  38.33 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  37.9 
 
 		 371 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  37.03 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1342  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 		 366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4088  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4237  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.905319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 375 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  33.95 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.95 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  25.58 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  28.77 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  26.53 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  25.64 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.27 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  22.66 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.67 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  22.48 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  30.54 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  26.46 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0779  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.32 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  24.54 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  26.46 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>