More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0396 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  82.03 
 
 		 423 aa  698    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  83.85 
 
 		 423 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  84.32 
 
 		 423 aa  708    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  83.22 
 
 		 423 aa  710    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  80.81 
 
 		 423 aa  671    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  80.61 
 
 		 423 aa  665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  81.56 
 
 		 423 aa  680    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  79.86 
 
 		 423 aa  677    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  100 
 
 		 423 aa  838    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  81.8 
 
 		 423 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  79.38 
 
 		 423 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  54.25 
 
 		 425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  49.29 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.82 
 
 		 426 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  50.12 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.29 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.64 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.94 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  45.52 
 
 		 424 aa  363  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  48.93 
 
 		 426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  45.73 
 
 		 425 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.71 
 
 		 437 aa  349  6e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  45.26 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  44.79 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  44.79 
 
 		 425 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  44.68 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  42.55 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  43.9 
 
 		 428 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  42.55 
 
 		 425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  42.79 
 
 		 425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  42.35 
 
 		 426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  43.26 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  42.79 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  42.79 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  42.79 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  42.79 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  42.79 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  42.79 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  42.72 
 
 		 428 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  43.5 
 
 		 425 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  43.5 
 
 		 425 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  42.79 
 
 		 431 aa  325  7e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  42.79 
 
 		 425 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  43.95 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  42.38 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  42.56 
 
 		 431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  42.69 
 
 		 446 aa  319  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  42.69 
 
 		 424 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  43.63 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.73 
 
 		 458 aa  317  4e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  42.02 
 
 		 435 aa  316  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  45.73 
 
 		 448 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  42.92 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  42.55 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  40.7 
 
 		 431 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  40.7 
 
 		 431 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  40.66 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  38.61 
 
 		 426 aa  308  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.86 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.09 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.91 
 
 		 425 aa  306  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  43.55 
 
 		 441 aa  305  8.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  38.66 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  42.46 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.72 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.49 
 
 		 425 aa  296  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  42.99 
 
 		 439 aa  295  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  41.74 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.97 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  42.19 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  41.75 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.19 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  42 
 
 		 439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  38.12 
 
 		 431 aa  286  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.18 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.53 
 
 		 442 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  38 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  37.09 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  39.49 
 
 		 431 aa  276  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.39 
 
 		 429 aa  275  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  36.62 
 
 		 427 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  38.5 
 
 		 428 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.32 
 
 		 441 aa  272  8.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.67 
 
 		 425 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  36.92 
 
 		 431 aa  272  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.67 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.74 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.15 
 
 		 436 aa  269  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.23 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1855  dihydroorotase-like protein  40.68 
 
 		 383 aa  268  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000930966  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0532  putative dihydroorotase-like protein  41.27 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106529 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  33.41 
 
 		 423 aa  262  8.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0543  dihydroorotase  40.32 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.23 
 
 		 433 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.23 
 
 		 433 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.75 
 
 		 427 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.79 
 
 		 433 aa  259  8e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  36.17 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  41.23 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.77 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>