278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3026 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  59.31 
 
 		 385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  63.45 
 
 		 248 aa  258  8e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  67.63 
 
 		 389 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  68.79 
 
 		 256 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  66.47 
 
 		 432 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  65.9 
 
 		 248 aa  248  8e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  65.32 
 
 		 358 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  60.85 
 
 		 242 aa  231  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  63.92 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  58.94 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  62.21 
 
 		 211 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  58.82 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  64.53 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  62.44 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  62.37 
 
 		 242 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  58.95 
 
 		 241 aa  218  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  58.95 
 
 		 241 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  59.44 
 
 		 211 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  59.44 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  53.43 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  64.61 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  61.76 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  54.12 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  57.56 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  56.02 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.25 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  64.84 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  55.45 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  52.3 
 
 		 269 aa  191  9e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  55.49 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  61.18 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  54.39 
 
 		 197 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  57.25 
 
 		 195 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  47.65 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.54 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  40.66 
 
 		 399 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  40.91 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  39.55 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  39.11 
 
 		 198 aa  133  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  38.82 
 
 		 198 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  42.33 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  39.53 
 
 		 352 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  40.24 
 
 		 198 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.34 
 
 		 534 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  40.24 
 
 		 198 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  40.24 
 
 		 198 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  40.24 
 
 		 198 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.93 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  38.2 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  38.2 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  37.7 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  40.49 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  38.37 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.88 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  41.72 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 		 198 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  38.42 
 
 		 442 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.17 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  38.42 
 
 		 442 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  38.42 
 
 		 442 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  38.42 
 
 		 442 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  40.96 
 
 		 206 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  37.88 
 
 		 455 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  37.88 
 
 		 456 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  37.88 
 
 		 456 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  39.52 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  37.56 
 
 		 340 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  37.14 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 345 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 345 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  38.95 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  36.31 
 
 		 193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  37.56 
 
 		 458 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  39.26 
 
 		 184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  41.32 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  33.8 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  36.31 
 
 		 193 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  39.44 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 181 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  32.42 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  38.37 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  39.05 
 
 		 178 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  37.68 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  38.66 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.44 
 
 		 200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  35.05 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  42.07 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  39.66 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  38.79 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  40.12 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>