More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2487 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.61 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3706  Phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 251 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175906  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3207  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2263  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.704103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3653  phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00889427  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0187  Phosphoglycerate mutase  36.74 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  34.13 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3479  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 221 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.95 
 
 		 427 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  39.23 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.33 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  36.43 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  29.01 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  31.45 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.05 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.05 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  29.01 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  27.12 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  31.45 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.05 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.87 
 
 		 369 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  36.43 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 411 aa  61.6  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.24 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  26.49 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.65 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  31.54 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  28.57 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  26.85 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  26.85 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.33 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2044  phosphatase PhoE  30.17 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.79 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  34.56 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  26.97 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  27.98 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  31.62 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  28.87 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  32.33 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  33.08 
 
 		 383 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  30.65 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  31.97 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  30.88 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  30.21 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  25.44 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  29.58 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  31.39 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>