59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2015 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2015  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  267  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.842391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 374 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 213 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 213 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  32.65 
 
 		 362 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 394 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 211 aa  47.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  29.49 
 
 		 370 aa  47.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  39.39 
 
 		 589 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  42.37 
 
 		 385 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04789  putative transcription regulator protein  44.83 
 
 		 232 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 316 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 378 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 		 586 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  37.93 
 
 		 380 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 215 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.59 
 
 		 536 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  41.67 
 
 		 568 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 320 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 362 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 362 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 362 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2543  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 201 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 398 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 		 588 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 349 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 329 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1445  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 308 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.446624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  36.99 
 
 		 395 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3397  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 328 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 950 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 227 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 378 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  31.4 
 
 		 209 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 333 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2939  regulatory protein LuxR  40 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 381 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 367 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  35.44 
 
 		 196 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  35.44 
 
 		 196 aa  41.2  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0514  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 493 aa  40.8  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.559597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  26.09 
 
 		 879 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 178 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 178 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 196 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 208 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 370 aa  40  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 391 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>