More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1620 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 173 aa  345  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  59.65 
 
 		 175 aa  205  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  59.39 
 
 		 168 aa  197  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  57.8 
 
 		 175 aa  194  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  57.8 
 
 		 175 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  57.8 
 
 		 175 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  57.8 
 
 		 175 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  56.4 
 
 		 172 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  56.4 
 
 		 174 aa  192  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  56.4 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  56.4 
 
 		 174 aa  192  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  56.4 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  56.4 
 
 		 174 aa  192  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  57.23 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  55.81 
 
 		 174 aa  191  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  55.81 
 
 		 174 aa  191  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  55.81 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  51.79 
 
 		 178 aa  174  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  50.3 
 
 		 175 aa  171  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 178 aa  165  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  52.05 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  45.39 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  43.37 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  48.03 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  39.75 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  44.13 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  40.99 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.77 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  36.42 
 
 		 198 aa  101  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  38.31 
 
 		 218 aa  95.1  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 225 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 225 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 221 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 221 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 221 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.8 
 
 		 201 aa  90.9  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  37.01 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  34.97 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 192 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  39.49 
 
 		 197 aa  88.2  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  31.49 
 
 		 209 aa  87.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  33.72 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  34.81 
 
 		 194 aa  84.3  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  34.64 
 
 		 197 aa  84  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 		 199 aa  84  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  41.88 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  39.61 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  38.26 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  40.52 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  41.51 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  42.31 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  45.88 
 
 		 703 aa  68.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.08 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  45.88 
 
 		 703 aa  68.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  36.94 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  42.57 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  41.94 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  39.13 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 127 aa  62  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  39.13 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  44.94 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  39.18 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  38.89 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  38.89 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  38.89 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  38.89 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  38.89 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  38.89 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  38.89 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  32.14 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 		 476 aa  58.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  35.05 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  36 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  36.11 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  34.04 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  30.3 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  35.64 
 
 		 102 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  37 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  30.77 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 271 aa  57  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 		 118 aa  57.4  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>