284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1493 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 528 aa  1061    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  60.71 
 
 		 516 aa  589  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  56.55 
 
 		 520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  57.54 
 
 		 524 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  56.55 
 
 		 520 aa  579  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  57.74 
 
 		 524 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  57.09 
 
 		 518 aa  581  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  57.74 
 
 		 524 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  57.34 
 
 		 524 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  56.3 
 
 		 521 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  55.95 
 
 		 520 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  56.94 
 
 		 521 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  57.14 
 
 		 521 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  56.15 
 
 		 519 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  56.94 
 
 		 521 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  59.09 
 
 		 514 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  56.94 
 
 		 524 aa  568  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  55.36 
 
 		 520 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  56.81 
 
 		 515 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  54.22 
 
 		 511 aa  558  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  54.09 
 
 		 517 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  58.13 
 
 		 532 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  58.13 
 
 		 532 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  57.4 
 
 		 540 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  58.8 
 
 		 531 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  57.83 
 
 		 540 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  56.34 
 
 		 528 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  58.6 
 
 		 531 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  57.6 
 
 		 531 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1004  histidine ammonia-lyase  51.18 
 
 		 511 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  45.55 
 
 		 715 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  43.06 
 
 		 540 aa  347  4e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  40.81 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  36.54 
 
 		 513 aa  269  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  34.85 
 
 		 508 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  35.24 
 
 		 508 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  37.53 
 
 		 516 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  35.82 
 
 		 511 aa  259  8e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  34.97 
 
 		 507 aa  256  7e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  33.75 
 
 		 498 aa  256  1.0000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  33.88 
 
 		 505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  35.69 
 
 		 509 aa  252  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  35.27 
 
 		 535 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  34.35 
 
 		 504 aa  251  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  34.35 
 
 		 504 aa  251  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  35.46 
 
 		 523 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  33.41 
 
 		 502 aa  249  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  33.84 
 
 		 507 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  34.66 
 
 		 520 aa  246  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  32.74 
 
 		 567 aa  246  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  36.42 
 
 		 523 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  37.14 
 
 		 504 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  35.76 
 
 		 526 aa  246  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  29.92 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  32.4 
 
 		 511 aa  240  4e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  32.85 
 
 		 505 aa  240  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  33.05 
 
 		 506 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  32.85 
 
 		 505 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  32.85 
 
 		 505 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  32.89 
 
 		 505 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  33.87 
 
 		 511 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  32.89 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1883  histidine ammonia-lyase  35.92 
 
 		 552 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0149  histidine ammonia-lyase  34.45 
 
 		 523 aa  239  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  32.85 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  32.89 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  32.24 
 
 		 509 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  36.56 
 
 		 508 aa  239  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  33.55 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  34.82 
 
 		 514 aa  238  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2406  histidine ammonia-lyase  34.66 
 
 		 552 aa  237  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138654  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  34.16 
 
 		 507 aa  236  7e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  34.51 
 
 		 519 aa  234  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  37.59 
 
 		 508 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  33.05 
 
 		 511 aa  233  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  31.03 
 
 		 505 aa  231  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  34.24 
 
 		 513 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  32.13 
 
 		 523 aa  230  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  35.59 
 
 		 511 aa  230  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  32.75 
 
 		 511 aa  229  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  34.01 
 
 		 533 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  34.18 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  34.25 
 
 		 511 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  34.37 
 
 		 515 aa  228  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  35.07 
 
 		 518 aa  227  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  34.75 
 
 		 509 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  35.28 
 
 		 530 aa  226  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  35.36 
 
 		 511 aa  225  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0175  histidine ammonia-lyase  32.91 
 
 		 567 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  35.22 
 
 		 511 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  35.35 
 
 		 507 aa  226  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  34.4 
 
 		 520 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  34.57 
 
 		 511 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  35.36 
 
 		 511 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  30.28 
 
 		 512 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  36.17 
 
 		 514 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4353  Histidine ammonia-lyase  36.4 
 
 		 507 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>