221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1417 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1417  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  306  6.999999999999999e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1897  CinA domain protein  46.91 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3619  CinA-like  46.2 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.45601  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1678  CinA-like  44.3 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7139  competence/damage-inducible protein cinA  41.77 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.876288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2030  CinA domain protein  49.32 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3350  CinA domain-containing protein  46.15 
 
 		 160 aa  124  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1740  competence/damage-inducible protein cinA  43.12 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386919  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32786  predicted protein  33.14 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  0.784272 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  28.95 
 
 		 415 aa  77  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  36.08 
 
 		 413 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  34.59 
 
 		 419 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  36.13 
 
 		 419 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  33.12 
 
 		 418 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  32.12 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  32.52 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.17 
 
 		 429 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.17 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  34.45 
 
 		 416 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  36.2 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  31.78 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  39.73 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  31.09 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  28.87 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.61 
 
 		 433 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  28.3 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  30.32 
 
 		 420 aa  62.4  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  35.29 
 
 		 418 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  31.62 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  31.25 
 
 		 413 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  30.26 
 
 		 418 aa  61.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  31.79 
 
 		 429 aa  61.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  34.15 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  33.33 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  31.2 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  29.17 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  32.5 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  34.95 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  33.05 
 
 		 416 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  30.17 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  40.91 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  28.75 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  32.93 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  33.06 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  27.27 
 
 		 400 aa  58.9  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 420 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  30.17 
 
 		 408 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  33.12 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1660  CinA domain protein  28.48 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000802014  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4280  competence/damage-inducible protein CinA  31.97 
 
 		 424 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.5 
 
 		 431 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  28.75 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  42.11 
 
 		 433 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.36 
 
 		 430 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  34.35 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  35.71 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  32.48 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  35.71 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  35.71 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  33.04 
 
 		 411 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  31.53 
 
 		 437 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  37.72 
 
 		 413 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  30.97 
 
 		 408 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  33.96 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  27.52 
 
 		 423 aa  54.3  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  31.29 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  28.86 
 
 		 415 aa  54.3  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 		 414 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  37.5 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  28.48 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  34.91 
 
 		 426 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06949  conserved hypothetical protein  58.7 
 
 		 523 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  26.92 
 
 		 418 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  24.84 
 
 		 415 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  30.51 
 
 		 430 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  31.97 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  30.46 
 
 		 414 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  29.71 
 
 		 414 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  31.9 
 
 		 417 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  34.62 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  30.33 
 
 		 423 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  27.04 
 
 		 423 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  25.95 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  27.03 
 
 		 416 aa  53.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0325  competence/damage-inducible protein CinA  31.2 
 
 		 424 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.58882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  32.45 
 
 		 218 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  36.21 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  32.45 
 
 		 431 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  29.03 
 
 		 424 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  31.62 
 
 		 425 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  34.75 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  35.48 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  30.77 
 
 		 412 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  31.79 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  31.62 
 
 		 425 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  31.62 
 
 		 425 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  28.95 
 
 		 412 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  37.5 
 
 		 432 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  29.2 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  30.88 
 
 		 403 aa  51.2  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>