More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3350 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3350  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7139  competence/damage-inducible protein cinA  61.64 
 
 		 160 aa  186  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.876288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3619  CinA-like  59.75 
 
 		 162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.45601  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1678  CinA-like  59.12 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1897  CinA domain protein  59.12 
 
 		 162 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2030  CinA domain protein  53.33 
 
 		 174 aa  148  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1740  competence/damage-inducible protein cinA  45.86 
 
 		 167 aa  124  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386919  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1417  CinA domain-containing protein  44.97 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32786  predicted protein  37.65 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  0.784272 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  36 
 
 		 429 aa  84  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  39.35 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  37.82 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  33.12 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  38.02 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  37.01 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  43.9 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  33.87 
 
 		 417 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  40 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  43.14 
 
 		 425 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  38.71 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.99 
 
 		 430 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  37.89 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  33.77 
 
 		 421 aa  77.4  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  37.8 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  47.87 
 
 		 414 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  42.59 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.25 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.45 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  29.58 
 
 		 430 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0933  competence/damage-inducible protein cinA  35.45 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.329163  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  38.24 
 
 		 411 aa  72  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  36.75 
 
 		 420 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  36.36 
 
 		 432 aa  72.4  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  30.72 
 
 		 413 aa  71.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  34.39 
 
 		 420 aa  70.9  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  37.01 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  40.2 
 
 		 415 aa  70.9  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  38.24 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  42.55 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  35.48 
 
 		 416 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  38.61 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  40.5 
 
 		 410 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  30.97 
 
 		 408 aa  68.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  40.59 
 
 		 415 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  39.67 
 
 		 408 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  35.29 
 
 		 412 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  30.72 
 
 		 418 aa  67.8  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  39.67 
 
 		 408 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  39.8 
 
 		 420 aa  67.8  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  35.29 
 
 		 412 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  33.11 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  38.24 
 
 		 418 aa  67.4  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  40.95 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  34.71 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  34.15 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  34.96 
 
 		 416 aa  67  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  33.93 
 
 		 413 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  41.27 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  34.15 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  31.48 
 
 		 423 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  39.22 
 
 		 411 aa  65.1  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  35.14 
 
 		 427 aa  65.1  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  35.06 
 
 		 399 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  31.45 
 
 		 415 aa  64.7  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  30.86 
 
 		 416 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  31.65 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.42 
 
 		 433 aa  64.7  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  27.67 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  35.44 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  34.81 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  28.66 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  31.43 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  31.65 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  31.65 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  39.22 
 
 		 412 aa  63.9  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  31.72 
 
 		 418 aa  63.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  34.21 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  31.06 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  41.94 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  38.02 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  32.67 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  34.71 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  31.65 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  31.65 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  34.81 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  31.01 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  31.65 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  31.65 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  43.12 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0005  competence/damage inducible protein CinA  34.23 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  31.65 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  27.92 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  42.31 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  29.93 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  31.65 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  31.65 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  36.36 
 
 		 412 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  33.33 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  38.24 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>