More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0954 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 445 aa  897    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  34.39 
 
 		 454 aa  243  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 		 499 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 466 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 464 aa  236  8e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 435 aa  236  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  37.03 
 
 		 473 aa  236  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  39.06 
 
 		 462 aa  233  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  35.27 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  35.88 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  37.26 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 469 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 		 443 aa  226  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 464 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 		 463 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 482 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 		 446 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 464 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 446 aa  216  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  38.42 
 
 		 462 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 442 aa  192  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  32.36 
 
 		 452 aa  186  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 425 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  32.11 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 425 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  35.05 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 425 aa  169  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 424 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  33.57 
 
 		 430 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  30.6 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 436 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 		 436 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 444 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 		 424 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 424 aa  156  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  32.52 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  29.93 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 		 430 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 462 aa  154  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  34.56 
 
 		 461 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 		 444 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  34.57 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.4 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.26 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  33.01 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.16 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.26 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.4 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 454 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.26 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  30.49 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  31.15 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 435 aa  150  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  31.15 
 
 		 430 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 425 aa  150  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 441 aa  150  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 430 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 428 aa  149  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>