More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3665 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  100 
 
 
364 aa  740    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  59.48 
 
 
361 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  64.01 
 
 
361 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  62.38 
 
 
361 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  62.38 
 
 
361 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  63.38 
 
 
361 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  63.38 
 
 
361 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  61.82 
 
 
363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  62.07 
 
 
361 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  62.12 
 
 
363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  62.82 
 
 
363 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  62.54 
 
 
364 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  53.03 
 
 
362 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  52.98 
 
 
363 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  48.96 
 
 
348 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  49.42 
 
 
350 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  49.13 
 
 
350 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  47.69 
 
 
350 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  50 
 
 
370 aa  325  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  50 
 
 
366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  48.24 
 
 
357 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  48.98 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  47.76 
 
 
363 aa  305  6e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  46.48 
 
 
372 aa  295  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  44 
 
 
367 aa  293  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  45.43 
 
 
353 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  44.21 
 
 
368 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  47.83 
 
 
353 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  45.45 
 
 
353 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  40.69 
 
 
361 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  46.9 
 
 
365 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  46.9 
 
 
351 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  39.07 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  39.47 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  38.67 
 
 
332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  36.7 
 
 
365 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  36.47 
 
 
329 aa  212  9e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  39.41 
 
 
338 aa  209  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  39.6 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  39.41 
 
 
332 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  37.54 
 
 
326 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  38.76 
 
 
329 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  37.42 
 
 
330 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  37.42 
 
 
330 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  36.75 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  38.03 
 
 
328 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  36.51 
 
 
330 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  29.6 
 
 
331 aa  149  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  33.98 
 
 
332 aa  146  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  33.99 
 
 
331 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  35.48 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  31.71 
 
 
332 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  30.66 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  31.71 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  31.25 
 
 
335 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  30.56 
 
 
335 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  30.56 
 
 
335 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  33.92 
 
 
345 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  31.14 
 
 
335 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  31.01 
 
 
332 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  30.21 
 
 
335 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  28.77 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  29.22 
 
 
303 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  27.78 
 
 
529 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  27.89 
 
 
499 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  27.65 
 
 
459 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  27.65 
 
 
459 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  27.65 
 
 
459 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  30.38 
 
 
513 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  27.65 
 
 
459 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  30.27 
 
 
513 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  27.3 
 
 
458 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  27.81 
 
 
493 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  27.36 
 
 
529 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  29.93 
 
 
513 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  27 
 
 
555 aa  95.9  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  26.62 
 
 
458 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  29.74 
 
 
509 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  30.26 
 
 
509 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  29.97 
 
 
511 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  29.97 
 
 
516 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  29.97 
 
 
511 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  29.97 
 
 
505 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  27.36 
 
 
529 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  29.97 
 
 
511 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  29.97 
 
 
562 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1244  Catalase  26.56 
 
 
487 aa  94.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  30.03 
 
 
517 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04660  catalase  26.42 
 
 
504 aa  93.2  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.651811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  29.24 
 
 
512 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  26.1 
 
 
459 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  27.1 
 
 
661 aa  92.8  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  27.27 
 
 
665 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  27.1 
 
 
665 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  26.77 
 
 
665 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  28.08 
 
 
515 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  28.33 
 
 
507 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2517  Catalase  26.84 
 
 
509 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  27.27 
 
 
665 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  27.27 
 
 
661 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>