267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0982 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  100 
 
 		 116 aa  238  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  72.41 
 
 		 116 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  85.71 
 
 		 70 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  44.95 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  50 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  46.27 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  43.28 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  44 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  45.83 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  39.44 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  48.44 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  37.84 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  36.99 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  38.96 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  37.33 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  38.57 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  42.19 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  35.53 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  37.14 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  44.78 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  39.02 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  34.72 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  34.72 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2587  glutaredoxin  33 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  32.61 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  43.08 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  35.71 
 
 		 384 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  51.35 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  45.65 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  43.08 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  37.18 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  32.98 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  39.39 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  31.88 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  35.38 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  38.81 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  38.81 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  42.19 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  34.78 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  37.14 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  36.62 
 
 		 391 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  40 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  37.5 
 
 		 383 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  32.26 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  28.89 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  32.5 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  40 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  48.72 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  36.84 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  37.68 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.82 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  39.06 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  35.38 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  32.35 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  36.92 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  38.1 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.31 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  34.33 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  34.38 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  36.76 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  31.82 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  40.68 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  30.77 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  39.29 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  36.92 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  36.23 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  34.29 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  33.82 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  35.29 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  35.44 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  37.68 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  30.14 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  30.14 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  41.3 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  45.95 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  31.33 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  46.15 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  44.74 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.29 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  38.81 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  36.96 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  34.78 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  37.5 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  31.82 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1969  hypothetical protein  28.81 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>