192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3258 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
132 aa  274  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  92.42 
 
 
132 aa  251  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  70.63 
 
 
137 aa  188  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  67.69 
 
 
132 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  67.69 
 
 
132 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  67.69 
 
 
132 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  67.69 
 
 
132 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  67.69 
 
 
132 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  66.92 
 
 
135 aa  180  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  66.92 
 
 
135 aa  180  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  67.69 
 
 
132 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  67.69 
 
 
132 aa  179  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  67.69 
 
 
132 aa  179  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  67.69 
 
 
132 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  67.69 
 
 
132 aa  179  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  67.69 
 
 
132 aa  179  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  67.69 
 
 
132 aa  179  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  67.69 
 
 
132 aa  179  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  67.69 
 
 
132 aa  179  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  66.15 
 
 
135 aa  178  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  67.72 
 
 
132 aa  177  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
137 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  36.36 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  34.19 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  33.03 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.7 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  26.89 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  35.24 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  30 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  34.55 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.96 
 
 
136 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.53 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.45 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1458  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.13 
 
 
132 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0173247  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  25.64 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.96 
 
 
142 aa  50.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
283 aa  50.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  24.26 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01560  thioesterase family protein  31.58 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.137848  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.62 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.58 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.26 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.62 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  26.09 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 
134 aa  47.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  27.13 
 
 
171 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  23.73 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.05 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  29.31 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.03 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
134 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
139 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  30.39 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  25.89 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  29.11 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.2 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  28.18 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  25.89 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.3 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  31.18 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.19 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.73 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  33.02 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0945  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.58 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0003  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00198303  unclonable  0.00000000031845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2260  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.93 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2091  hypothetical protein  27.12 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2770  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397297  normal  0.706445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  31.18 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1215  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.61 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  25 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  25 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.41 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.21 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  32.89 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0066  thioesterase superfamily protein  31 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1214  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.859401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>