More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4571 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.41 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  31.34 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  33.5 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  34.27 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  30.67 
 
 		 282 aa  91.7  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  33.49 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  25.94 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  30.99 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 231 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  24.66 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  29.63 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  26.92 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  25 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  33.94 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  25 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  32.87 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  24.53 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  24.53 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  24.53 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  28.57 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  28.4 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  35.24 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  33.33 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  31.68 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  30.05 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  28.37 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  30.85 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  29.39 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  27.6 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.52 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7867  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  33.75 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  30.57 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_003296  RS00404  hypothetical protein  32.7 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000519632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  29.65 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  27.05 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  29.9 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  27.78 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  24.3 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  24.64 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  28.12 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  28.48 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  28.83 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  28.14 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  31.48 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  28.4 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.19 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  29.27 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  26.64 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  26.06 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  30.19 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1448  hypothetical protein  30.25 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  31.51 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  25.3 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  29.34 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  28.48 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>