132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3121 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  100 
 
 		 223 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  59.19 
 
 		 228 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  55.2 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  54.71 
 
 		 221 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  56.5 
 
 		 232 aa  234  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  54.26 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  54.71 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  52.36 
 
 		 223 aa  228  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  51.15 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  41.26 
 
 		 240 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  34.12 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  38.99 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  36.44 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  36 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  35.56 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  32 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 234 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  33.77 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  34.39 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  28.7 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 236 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  34.38 
 
 		 266 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  34.08 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  34.08 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  34.08 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  32.46 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  26.58 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  31.34 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  33.51 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  36.18 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  36.18 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  27.83 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  20.19 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.4 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  32 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  25.93 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  24.3 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  24.27 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  24.36 
 
 		 267 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 363 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  22.58 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  23.32 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  23.08 
 
 		 270 aa  52.4  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  30.58 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  23.08 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.36 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  23.68 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  27.75 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.36 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  30 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  18.43 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  33.07 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19651  hypothetical protein  24.18 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  22.42 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  23.25 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  23.25 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  23.25 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  22.65 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  25.47 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  24.56 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  23.89 
 
 		 351 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  26.71 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  34.3 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  25.64 
 
 		 351 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  29.75 
 
 		 363 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  26.6 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  30.51 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  26.71 
 
 		 262 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  22.42 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  24.56 
 
 		 351 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1672  methyltransferase type 12  26.85 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  31.37 
 
 		 364 aa  45.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  26.23 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  29.81 
 
 		 353 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  32.99 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  29.81 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  19.43 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  24.06 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  25.66 
 
 		 351 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  26.96 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  29.57 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  31.82 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  29.1 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1783  Methyltransferase type 11  25.4 
 
 		 300 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0801  putative methyltransferase  33.62 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0142  hypothetical protein  22.69 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.233923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>