More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1778 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  100 
 
 
249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  95.98 
 
 
249 aa  496  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  67.87 
 
 
249 aa  358  6e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  63.05 
 
 
249 aa  342  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  65.43 
 
 
244 aa  333  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  58.78 
 
 
250 aa  309  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  59.84 
 
 
250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  59.84 
 
 
250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  60.43 
 
 
250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  56.22 
 
 
250 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  55.1 
 
 
250 aa  287  9e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  53.02 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  52.1 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  50.67 
 
 
228 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 
361 aa  229  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  51.5 
 
 
248 aa  225  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  47.98 
 
 
242 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  51.07 
 
 
245 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  49.12 
 
 
229 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  49.12 
 
 
229 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  49.56 
 
 
230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  49.56 
 
 
230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  49.57 
 
 
356 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  48.03 
 
 
357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  49.78 
 
 
356 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  48.46 
 
 
233 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  49.13 
 
 
356 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  49.78 
 
 
232 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  49.57 
 
 
356 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  48.9 
 
 
232 aa  215  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.13 
 
 
357 aa  215  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  50.67 
 
 
229 aa  210  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  46.02 
 
 
229 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  48.02 
 
 
230 aa  210  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  43.67 
 
 
345 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  43.4 
 
 
346 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  49.78 
 
 
356 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  49.78 
 
 
356 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  49.34 
 
 
356 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  69.63 
 
 
186 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  42.55 
 
 
346 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  45.78 
 
 
239 aa  202  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  44.83 
 
 
344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  46.02 
 
 
233 aa  198  9e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  46.02 
 
 
233 aa  197  9e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  44.78 
 
 
233 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  40.09 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  39.66 
 
 
235 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  38.94 
 
 
346 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  36.09 
 
 
354 aa  135  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  36.62 
 
 
220 aa  125  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 
288 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  30.45 
 
 
288 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 
297 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 
214 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  29.86 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  30.68 
 
 
287 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  29.75 
 
 
294 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.78 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  36.45 
 
 
251 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 
289 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 
294 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  29.66 
 
 
300 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  29.66 
 
 
307 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  27.44 
 
 
288 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  29.66 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  27.44 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  28.67 
 
 
297 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  29.03 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 
208 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
289 aa  109  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
289 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  39.89 
 
 
397 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0956  metallo-beta-lactamase family protein  35.64 
 
 
291 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1071  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 
244 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.86 
 
 
215 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 
206 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.82 
 
 
211 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 
202 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  31.65 
 
 
214 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
297 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3744  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 
306 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  27.41 
 
 
295 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  30.98 
 
 
266 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  33.49 
 
 
209 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 
295 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
296 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  29.37 
 
 
307 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.64 
 
 
236 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.06 
 
 
299 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  28.62 
 
 
294 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.26 
 
 
290 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  28.04 
 
 
432 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  32.38 
 
 
207 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>