211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2040 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  39.92 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  37.92 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  32.92 
 
 		 240 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  33.47 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2552  Smr protein/MutS2-like  34.3 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049818  hitchhiker  0.000000000032251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  32.73 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  39.39 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  37.76 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1865  Smr protein/MutS2  30.23 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00151005  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  29.19 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  32.61 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  38.68 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  38.83 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  29.95 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  28.09 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  32.22 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  27.53 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  36.27 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  39.81 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  36.11 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  38.68 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  41.3 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  35.71 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  38.32 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  37.25 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  34.26 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  39 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  37.62 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  35.71 
 
 		 299 aa  62  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  30.05 
 
 		 198 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  34.62 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  35.19 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  41.84 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  34.43 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  27.04 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  33.59 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  34.69 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  33.77 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  40 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  40 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  33.57 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  33.59 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  35.83 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  34.06 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  29.19 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  40 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  31.73 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  31.78 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  35.71 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  37.3 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  34.62 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  38.14 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  37 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  39.39 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  37 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  37.11 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02757  Smr protein/MutS2  31.01 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0356192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  33.56 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  36.54 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  33.9 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  33.9 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  30.05 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  25.68 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  32.62 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  35.05 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  30.53 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  35 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  34 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  34 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  35.19 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  34 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  34 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  34 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  34 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  34 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  34 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1254  Smr domain-containing protein  34.34 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  32.35 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  34.02 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  27.41 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  33.01 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  32.14 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  33.33 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  32.99 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  32.99 
 
 		 278 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  32.99 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  32.99 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  32.14 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  37.04 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  32.99 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  27.84 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  26.09 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  33.67 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  36.89 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  36.94 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  30.12 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  36.27 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  36.89 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>