140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1254 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1254  Smr domain-containing protein  100 
 
 		 170 aa  353  6.999999999999999e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  38.2 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  38.2 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  38.2 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  37.62 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  38.54 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  36.47 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  34.34 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  36.47 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  42.86 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  37.78 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  29.3 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  38.37 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  38.82 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  35.96 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  36 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  36.47 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  36.52 
 
 		 236 aa  54.3  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  30.68 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  28.66 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2552  Smr protein/MutS2-like  40.48 
 
 		 242 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049818  hitchhiker  0.000000000032251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  39.02 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  37.04 
 
 		 234 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  29.55 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  32.97 
 
 		 780 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004195  hypothetical protein  31.71 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000447075  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  38.55 
 
 		 219 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  34.12 
 
 		 217 aa  52.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  36.59 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  34.88 
 
 		 266 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  34.04 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  37.21 
 
 		 278 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  32.58 
 
 		 180 aa  52  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  37.21 
 
 		 247 aa  52  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  31.82 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  37.21 
 
 		 259 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  37.21 
 
 		 259 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  34.12 
 
 		 218 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  37.21 
 
 		 259 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  36.05 
 
 		 259 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  37.21 
 
 		 245 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  37.21 
 
 		 245 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  34.88 
 
 		 226 aa  51.2  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  37.21 
 
 		 245 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  37.21 
 
 		 245 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  37.21 
 
 		 245 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  37.21 
 
 		 245 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  37.21 
 
 		 245 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  31.19 
 
 		 221 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  36.46 
 
 		 234 aa  50.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  34.88 
 
 		 230 aa  50.8  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  34.88 
 
 		 219 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  38.55 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  31.19 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  34.88 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  30.49 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01259  hypothetical protein  30.49 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  36.47 
 
 		 292 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  34.09 
 
 		 779 aa  50.4  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  33.33 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  36.17 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  36.17 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  34.83 
 
 		 233 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  36.26 
 
 		 757 aa  48.5  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  36.26 
 
 		 757 aa  48.5  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  36.17 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  30.28 
 
 		 270 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  51.16 
 
 		 368 aa  48.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  32.94 
 
 		 256 aa  47.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  30.23 
 
 		 213 aa  47.8  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  33.73 
 
 		 189 aa  47.8  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 192 aa  47.4  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  33.33 
 
 		 192 aa  47.4  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  31.73 
 
 		 785 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  34.52 
 
 		 242 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  28.92 
 
 		 257 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  30.34 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  31.76 
 
 		 227 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  30.3 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  27 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  27.71 
 
 		 257 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  36.71 
 
 		 259 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  25.47 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  32.58 
 
 		 225 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  26.14 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  22.09 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  25.47 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  29.9 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  30.3 
 
 		 200 aa  45.1  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1444  Smr protein/MutS2  30.95 
 
 		 243 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  29.17 
 
 		 787 aa  44.7  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0248  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.75 
 
 		 734 aa  44.3  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  27.47 
 
 		 186 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  29.11 
 
 		 776 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0971  hypothetical protein  29.76 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0507047  hitchhiker  0.00239069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  30.59 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  24.03 
 
 		 812 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  31.73 
 
 		 778 aa  43.9  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  28.37 
 
 		 769 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  27.5 
 
 		 792 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>