170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1848 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  94.5 
 
 		 327 aa  658    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  91.44 
 
 		 327 aa  636    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  694    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  92.66 
 
 		 327 aa  648    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  90.83 
 
 		 327 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  90.21 
 
 		 327 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  76.15 
 
 		 327 aa  542  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  57.83 
 
 		 323 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  54.94 
 
 		 325 aa  381  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  57.72 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  54.32 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  56.31 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  54.01 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  55.56 
 
 		 325 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  54.01 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  58.47 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  57.51 
 
 		 325 aa  371  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  54.01 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  54.74 
 
 		 326 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  57.83 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  57.83 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  57.23 
 
 		 326 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  56.27 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  55.97 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  57.19 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  53.7 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  56.55 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  56.87 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  56.23 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  54.63 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  57.83 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  55.56 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  54.01 
 
 		 325 aa  364  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  56.87 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  53.7 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  55.91 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  57.51 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  57.51 
 
 		 325 aa  362  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  57.83 
 
 		 325 aa  362  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  56.23 
 
 		 325 aa  361  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  56.23 
 
 		 325 aa  361  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  56.87 
 
 		 325 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  55.91 
 
 		 325 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  56.55 
 
 		 325 aa  358  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  56.43 
 
 		 325 aa  358  7e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  57.47 
 
 		 316 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  56.23 
 
 		 325 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  56.87 
 
 		 325 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  56.23 
 
 		 325 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  56.23 
 
 		 325 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  55.91 
 
 		 325 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  56.23 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  55.27 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  53.67 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  55.59 
 
 		 325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  54.63 
 
 		 326 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  53.67 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  53.67 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  53.67 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  53.67 
 
 		 323 aa  345  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  54.31 
 
 		 326 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  51.85 
 
 		 328 aa  344  8.999999999999999e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  52.87 
 
 		 325 aa  340  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  53.04 
 
 		 325 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  56.33 
 
 		 319 aa  338  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  54.57 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  52.08 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  52.4 
 
 		 325 aa  335  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  52.16 
 
 		 326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  45.13 
 
 		 370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  56.79 
 
 		 293 aa  323  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  51.95 
 
 		 336 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  55.72 
 
 		 271 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  44.66 
 
 		 370 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  44.61 
 
 		 347 aa  295  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  44.74 
 
 		 344 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  43.66 
 
 		 341 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  44.38 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  46.08 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  43.86 
 
 		 344 aa  292  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  43.4 
 
 		 345 aa  292  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  43.2 
 
 		 349 aa  291  8e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  49.48 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  44.44 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  43.57 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  43.66 
 
 		 341 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  43.57 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  43.36 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  44.25 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  48.62 
 
 		 336 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  42.57 
 
 		 347 aa  285  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1890  hypothetical protein  89.8 
 
 		 147 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0896786  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  44.92 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  43.15 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  42.18 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1902  hypothetical protein  86.39 
 
 		 147 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.266524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  60 
 
 		 208 aa  266  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  55.98 
 
 		 213 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  56.22 
 
 		 238 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0882  hypothetical protein  76.35 
 
 		 153 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>