More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0988 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 266 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  71.97 
 
 		 265 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  73.11 
 
 		 265 aa  400  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  69.58 
 
 		 264 aa  387  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  46.67 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  40.96 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 263 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  40.23 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  35.94 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  40.67 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  40.39 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  40.54 
 
 		 259 aa  155  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  39.45 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  37.79 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  37.83 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  37.74 
 
 		 264 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  39.13 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  37.74 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  36.72 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0222  stationary phase survival protein SurE  37.78 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  36.07 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  36.96 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  36.96 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 		 250 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  32.73 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  39.27 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  37.98 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  39.44 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 		 255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  40.33 
 
 		 244 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  36.44 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  38.8 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  36.73 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  36.09 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  37.14 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  36.59 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0090  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  34.93 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  37.1 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  36.92 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  36.59 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2782  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  36.59 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  35.92 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  36.69 
 
 		 252 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  34.12 
 
 		 269 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  34.23 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5029  stationary phase survival protein SurE  35.92 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0881  stationary-phase survival protein SurE  36.23 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.704956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  35.94 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1160  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.141481  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1414  stationary phase survival protein SurE  36.65 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1080  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200755  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  37.08 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  35.08 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  35.91 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 253 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 253 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  34.14 
 
 		 259 aa  122  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 255 aa  121  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 248 aa  121  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  34.62 
 
 		 250 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  35.84 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  35.98 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  36.96 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  36.4 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>