141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1898 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  43.16 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  47.43 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2473  protein of unknown function DUF541  43.98 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.065986  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1791  hypothetical protein  38.6 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  25.65 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  34.3 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  26.92 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  28.99 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  32.53 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  26.42 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  29.34 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  26.83 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  25.69 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  24.38 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  30.99 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  26.5 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  30.51 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  26.09 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  31.75 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  30.33 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  25.63 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  25.94 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  23.84 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  26.01 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  27.36 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  26.35 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  25.41 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  28.66 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  25.97 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  27.95 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  25.97 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  25.41 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  23.43 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  28.44 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  26.67 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  25.87 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  29.83 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  26.5 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  27.11 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2333  hypothetical protein  24.45 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0753305 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  23.81 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  26.5 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3882  hypothetical protein  24.86 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  28 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  25.41 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  28.06 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  28.37 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  26.64 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  29.38 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  25.71 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  27.93 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  27.01 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2298  protein of unknown function DUF541  26.67 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.568892 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  28.91 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  25.64 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  25.43 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  24.03 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2904  protein of unknown function DUF541  28.89 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.369203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  26.11 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0517  hypothetical protein  24.31 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4106  hypothetical protein  28.7 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.62913e-48 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  27.63 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  25.68 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  24.74 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  24.17 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  29.56 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  24.74 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  24.74 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  24.74 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  24.74 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  25.61 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  24.51 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  27.31 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  23.79 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  27.23 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  25.11 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  23.81 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  23.81 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  24.21 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  24.21 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  24.21 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  23.5 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  25.69 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  24.21 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  24.21 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  24.21 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  24.21 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  24.21 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  24.21 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>