More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03063 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03063  probable two-component response regulator  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4606  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.98 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2394  two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0518821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1540  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3388  two component transcriptional regulator  33.66 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2671  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5378  response regulator receiver protein  35.02 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  29.77 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1025  two component transcriptional regulator  32.27 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417875  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0200  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0943  two component transcriptional regulator  31.98 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0224  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.58 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2270  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 244 aa  92  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3280  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  30.56 
 
 		 249 aa  89  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  29.95 
 
 		 252 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2511  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.02 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.73 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0376  two component transcriptional regulator  28.16 
 
 		 240 aa  84.7  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  29.28 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2065  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0454664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  30.23 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00998  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with TorS  32.08 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2647  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.08 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149157  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01005  hypothetical protein  32.08 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.23 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1106  DNA-binding transcriptional regulator TorR  32.08 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2600  DNA-binding transcriptional regulator TorR  32.08 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1230  DNA-binding transcriptional regulator TorR  32.08 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2320  DNA-binding transcriptional regulator TorR  32.08 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.369642  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1111  DNA-binding transcriptional regulator TorR  32.08 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1898  two component transcriptional regulator  27.36 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458999  normal  0.479409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2130  DNA-binding transcriptional regulator TorR  32.08 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2473  DNA-binding response regulator  30.52 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.31 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  28.17 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  28.17 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0479  two component transcriptional regulator  29.67 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3686  two component transcriptional regulator  30.28 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  32.08 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4107  DNA-binding transcriptional regulator TorR  31.28 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2788  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  32.41 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4052  DNA-binding transcriptional regulator TorR  31.28 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4214  DNA-binding transcriptional regulator TorR  31.28 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4156  DNA-binding transcriptional regulator TorR  31.28 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4035  DNA-binding transcriptional regulator TorR  31.28 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4120  DNA-binding response regulator CreB  29.38 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1091  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1643  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  28.85 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  26.51 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2580  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.66 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.51 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.9 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2146  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.94 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0956  two component transcriptional regulator  28.71 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.357771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  29.3 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2281  two-component transcriptional regulator  28.71 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1956  two component transcriptional regulator  33.01 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000121146  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3392  response regulator transcription regulator protein  30.09 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1563  two component transcriptional regulator  30.88 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2487  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.98 
 
 		 735 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3685  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25223  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.12 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.52 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  30.37 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1542  response regulator receiver protein  29.33 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  31.05 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  31.05 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2245  two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  32.71 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  30.37 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  32.71 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2924  two component transcriptional regulator  33.68 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  32.71 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  30.37 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  30.37 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  30.37 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2799  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1866  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  28.16 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  30.37 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1138  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  30.37 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.88 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  30.37 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.56 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  30.56 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2909  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.999783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3012  two component transcriptional regulator  34.95 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0092  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.34 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3836  DNA-binding transcriptional regulator BasR  32.54 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2215  two component transcriptional regulator  29.67 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>