More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00660 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  78.35 
 
 		 712 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00660  peptidyl-dipeptidase dcp  100 
 
 		 409 aa  835    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207806  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1262  peptidyl-dipeptidase Dcp  53.79 
 
 		 716 aa  422  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.776976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  53.94 
 
 		 718 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  52.75 
 
 		 723 aa  398  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  53.32 
 
 		 723 aa  398  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.75 
 
 		 716 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  52.55 
 
 		 722 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.5 
 
 		 716 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.88 
 
 		 716 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.5 
 
 		 716 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.64 
 
 		 733 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.01 
 
 		 717 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.26 
 
 		 716 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.77 
 
 		 716 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  47.01 
 
 		 716 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.02 
 
 		 716 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1628  dipeptidyl carboxypeptidase II  44.16 
 
 		 681 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2120  dipeptidyl carboxypeptidase II  44.16 
 
 		 681 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000189096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0181  Peptidyl-dipeptidase Dcp  49.25 
 
 		 718 aa  350  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.585787 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01497  dipeptidyl carboxypeptidase II  43.91 
 
 		 681 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000554972  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2107  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.91 
 
 		 681 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100258  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01508  hypothetical protein  43.91 
 
 		 681 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000866306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1747  dipeptidyl carboxypeptidase II  43.91 
 
 		 681 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000176461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1702  dipeptidyl carboxypeptidase II  43.91 
 
 		 681 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0043073  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1172  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.83 
 
 		 718 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2154  dipeptidyl carboxypeptidase II  43.65 
 
 		 681 aa  346  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000542867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1627  dipeptidyl carboxypeptidase II  44.16 
 
 		 681 aa  345  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000101595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.26 
 
 		 714 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.04 
 
 		 711 aa  341  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.72 
 
 		 722 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1683  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.2 
 
 		 680 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.897722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1624  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.2 
 
 		 680 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1615  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.2 
 
 		 680 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.418466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1659  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.2 
 
 		 680 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.037506  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.2 
 
 		 712 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.31 
 
 		 734 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8022  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.73 
 
 		 659 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.1 
 
 		 683 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.73 
 
 		 718 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.06 
 
 		 734 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.75 
 
 		 742 aa  322  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.75 
 
 		 742 aa  322  6e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.75 
 
 		 742 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_002950  PG0758  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.53 
 
 		 695 aa  320  3e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.703412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.81 
 
 		 734 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.56 
 
 		 734 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4856  Peptidyl-dipeptidase Dcp  46.19 
 
 		 691 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112436  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1889  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.69 
 
 		 680 aa  316  4e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.994052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1940  dipeptidyl carboxypeptidase II  43.37 
 
 		 679 aa  317  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.77 
 
 		 711 aa  315  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.15 
 
 		 720 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.78 
 
 		 716 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0817  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.99 
 
 		 726 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.163451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.77 
 
 		 714 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.06 
 
 		 715 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.77 
 
 		 727 aa  311  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.06 
 
 		 715 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6132 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.8 
 
 		 714 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.54 
 
 		 714 aa  310  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.01 
 
 		 714 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.01 
 
 		 714 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1525  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.8 
 
 		 715 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.55 
 
 		 714 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.82 
 
 		 726 aa  306  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.69 
 
 		 726 aa  305  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5541  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.8 
 
 		 677 aa  305  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.09 
 
 		 726 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.46 
 
 		 730 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.92 
 
 		 725 aa  296  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.24 
 
 		 736 aa  292  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1054  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.39 
 
 		 655 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.391003  normal  0.428625 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.39 
 
 		 729 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.01 
 
 		 689 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2039  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40.87 
 
 		 670 aa  279  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  39.85 
 
 		 709 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.76 
 
 		 689 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2313  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.9 
 
 		 670 aa  272  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0197787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.15 
 
 		 687 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3161  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.18 
 
 		 728 aa  269  8e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  37.8 
 
 		 694 aa  263  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21040  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.75 
 
 		 699 aa  262  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.547895  normal  0.690567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2254  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.55 
 
 		 708 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.89 
 
 		 696 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0514  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.9 
 
 		 672 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0408972  normal  0.0574959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3616  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40.46 
 
 		 682 aa  259  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.751531  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  39.24 
 
 		 693 aa  258  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.57 
 
 		 694 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1825  peptidyl-dipeptidase dcp  41.07 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.425025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.38 
 
 		 716 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0938  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.78 
 
 		 687 aa  256  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964054  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1048  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.45 
 
 		 687 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.84 
 
 		 696 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38.17 
 
 		 695 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.32 
 
 		 681 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38.27 
 
 		 848 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3217  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.88 
 
 		 717 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3302  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.13 
 
 		 717 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335869  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5074  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.38 
 
 		 679 aa  249  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.08 
 
 		 671 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>