299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1825 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1683  dipeptidyl carboxypeptidase II  98.45 
 
 		 680 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.897722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1825  peptidyl-dipeptidase dcp  100 
 
 		 360 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.425025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1624  dipeptidyl carboxypeptidase II  99.07 
 
 		 680 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1659  dipeptidyl carboxypeptidase II  99.07 
 
 		 680 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.037506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1615  dipeptidyl carboxypeptidase II  99.38 
 
 		 680 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.418466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1628  dipeptidyl carboxypeptidase II  74.77 
 
 		 681 aa  481  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01497  dipeptidyl carboxypeptidase II  74.45 
 
 		 681 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000554972  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2107  Peptidyl-dipeptidase Dcp  74.45 
 
 		 681 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2154  dipeptidyl carboxypeptidase II  74.45 
 
 		 681 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000542867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01508  hypothetical protein  74.45 
 
 		 681 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000866306  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1702  dipeptidyl carboxypeptidase II  74.45 
 
 		 681 aa  478  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0043073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1747  dipeptidyl carboxypeptidase II  74.14 
 
 		 681 aa  478  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000176461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2120  dipeptidyl carboxypeptidase II  74.45 
 
 		 681 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000189096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1627  dipeptidyl carboxypeptidase II  73.83 
 
 		 681 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000101595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1940  dipeptidyl carboxypeptidase II  69.59 
 
 		 679 aa  431  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  58.62 
 
 		 733 aa  353  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  50 
 
 		 723 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.84 
 
 		 723 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  49.06 
 
 		 722 aa  279  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.63 
 
 		 716 aa  279  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.95 
 
 		 716 aa  279  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.95 
 
 		 716 aa  278  8e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.63 
 
 		 716 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.26 
 
 		 717 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0758  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.45 
 
 		 695 aa  275  1.0000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.703412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.89 
 
 		 712 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.63 
 
 		 716 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.32 
 
 		 716 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.32 
 
 		 716 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0181  Peptidyl-dipeptidase Dcp  47.35 
 
 		 718 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.01 
 
 		 716 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0817  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.14 
 
 		 726 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.163451 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00660  peptidyl-dipeptidase dcp  41.07 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207806  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.18 
 
 		 714 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.88 
 
 		 711 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1262  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.19 
 
 		 716 aa  242  7.999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.776976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1172  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.44 
 
 		 718 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1889  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40.69 
 
 		 680 aa  232  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.994052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.63 
 
 		 712 aa  232  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.37 
 
 		 718 aa  232  8.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.99 
 
 		 722 aa  228  8e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40.5 
 
 		 714 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.5 
 
 		 714 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.44 
 
 		 714 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.44 
 
 		 714 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.5 
 
 		 714 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.06 
 
 		 689 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.8 
 
 		 715 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6132 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.36 
 
 		 716 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.36 
 
 		 720 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1525  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.8 
 
 		 715 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.12 
 
 		 683 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.47 
 
 		 715 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5541  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.93 
 
 		 677 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.42 
 
 		 726 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  34.1 
 
 		 736 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  33.64 
 
 		 730 aa  206  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  34.15 
 
 		 726 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.51 
 
 		 725 aa  202  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.91 
 
 		 718 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.79 
 
 		 714 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  34.58 
 
 		 726 aa  199  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  36.84 
 
 		 711 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  35.71 
 
 		 709 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.2 
 
 		 687 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3161  peptidyl-dipeptidase Dcp  33.86 
 
 		 728 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4856  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40.14 
 
 		 691 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112436  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.36 
 
 		 689 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  32.71 
 
 		 729 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  33.33 
 
 		 742 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  33.33 
 
 		 742 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  33.33 
 
 		 742 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  35.09 
 
 		 693 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  34.27 
 
 		 734 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  34.27 
 
 		 734 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  34.27 
 
 		 734 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  33.64 
 
 		 734 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0413  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.42 
 
 		 699 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8022  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.65 
 
 		 659 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.42 
 
 		 716 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  34.19 
 
 		 682 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  31.66 
 
 		 727 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2934  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.62 
 
 		 689 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3217  Peptidyl-dipeptidase Dcp  35.11 
 
 		 717 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738556  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  34.67 
 
 		 675 aa  179  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0483  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.45 
 
 		 699 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.11 
 
 		 671 aa  178  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3302  Peptidyl-dipeptidase Dcp  35.11 
 
 		 717 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335869  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1054  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.62 
 
 		 655 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.391003  normal  0.428625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  36.45 
 
 		 685 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  34.89 
 
 		 681 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  34.53 
 
 		 682 aa  176  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  34.48 
 
 		 696 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2039  Peptidyl-dipeptidase Dcp  37.03 
 
 		 670 aa  176  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153602 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  34.53 
 
 		 733 aa  175  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1048  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.06 
 
 		 687 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  34.52 
 
 		 694 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.48 
 
 		 695 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1191  Peptidyl-dipeptidase Dcp  36.94 
 
 		 705 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.130613  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.11 
 
 		 696 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>