More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5245 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  100 
 
 		 261 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  96.93 
 
 		 261 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  88.12 
 
 		 261 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0306  extracellular solute-binding protein  80.26 
 
 		 261 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1916  extracellular solute-binding protein  72.44 
 
 		 261 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189267 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  62.2 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5541  extracellular solute-binding protein family 3  59 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2073  extracellular solute-binding protein  62.66 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.19851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  61.48 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  61.48 
 
 		 267 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5265  extracellular solute-binding protein family 3  57.47 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3329  extracellular solute-binding protein  58.17 
 
 		 262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3190  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  58.17 
 
 		 262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0932  extracellular solute-binding protein  57.48 
 
 		 263 aa  301  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  56.47 
 
 		 268 aa  298  7e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3449  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  57.37 
 
 		 262 aa  297  9e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3469  extracellular solute-binding protein family 3  56.08 
 
 		 268 aa  297  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0907  extracellular solute-binding protein family 3  56.85 
 
 		 254 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0877  extracellular solute-binding protein family 3  58.65 
 
 		 240 aa  291  7e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  60.68 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  60.68 
 
 		 268 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  60.68 
 
 		 268 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2257  extracellular solute-binding protein  61.8 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  53.7 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2432  glutamine ABC transporter extracellular solute-binding family 3 protein  54.23 
 
 		 263 aa  281  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.0748361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  57.14 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0017  extracellular solute-binding protein family 3  57.14 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0230  extracellular solute-binding protein  56.3 
 
 		 268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2103  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  56.67 
 
 		 267 aa  272  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  52.94 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3472  extracellular solute-binding protein  52.02 
 
 		 266 aa  265  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0211  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 		 274 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3211  extracellular solute-binding protein  52.53 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3667  extracellular solute-binding protein family 3  52.78 
 
 		 266 aa  261  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.200232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0161  extracellular solute-binding protein  53.63 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.445955  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  49.06 
 
 		 274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  48.68 
 
 		 274 aa  251  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1501  extracellular solute-binding protein  51.61 
 
 		 265 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4065  extracellular solute-binding protein  53.22 
 
 		 264 aa  244  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0712099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6715  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  50.63 
 
 		 274 aa  241  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3247  extracellular solute-binding protein  49.79 
 
 		 269 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3989  extracellular solute-binding protein family 3  42.02 
 
 		 265 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.128732 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  38.76 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  39.83 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3417  extracellular solute-binding protein family 3  36.86 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  37.15 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  38.75 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  35.9 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  36.94 
 
 		 255 aa  154  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  38.53 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  35.93 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  34.73 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4667  extracellular solute-binding protein  35 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  32.69 
 
 		 276 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4927  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  33.05 
 
 		 276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 		 268 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5457  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  32.5 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2438  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  29.96 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  34.41 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  31.25 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  33.74 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  33.74 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3463  extracellular solute-binding protein family 3  30.99 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  30.42 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  34.73 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.02 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.96 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.96 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  34.96 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  30.53 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3951  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.43 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4545  extracellular solute-binding protein family 3  31.06 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486502  normal  0.0898328 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  32.49 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  30.35 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7667  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  32.49 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  29.3 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3868  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2434  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.92 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.09 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>