51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2725 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  100 
 
 		 105 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  95.24 
 
 		 105 aa  207  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  87.5 
 
 		 105 aa  193  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  87.5 
 
 		 105 aa  193  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  87.5 
 
 		 105 aa  192  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  87.5 
 
 		 105 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  86.54 
 
 		 105 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  75.73 
 
 		 103 aa  161  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  73.33 
 
 		 104 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  73.33 
 
 		 104 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  64.76 
 
 		 104 aa  144  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  63.37 
 
 		 104 aa  130  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  51.92 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  45.19 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  35.92 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  45.88 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  34.91 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1523  sterol-binding domain-containing protein  34.31 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  34.31 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 		 913 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  35 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  35 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 710 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  30.43 
 
 		 375 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  32.1 
 
 		 667 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  29.09 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  24.14 
 
 		 595 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  27.96 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  30.39 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 		 229 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0143  sterol-binding domain-containing protein  26.47 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110171  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0137  sterol-binding domain-containing protein  25.96 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  48.89 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  47.83 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0960  sterol-binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0043  hypothetical protein  28.12 
 
 		 334 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0701676  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1772  sterol-binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  25.49 
 
 		 677 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6473  Sterol-binding domain protein  29.21 
 
 		 114 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1608  hypothetical protein  28.21 
 
 		 131 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.04 
 
 		 450 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  27.55 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  27.55 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1743  hypothetical protein  47.06 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0765489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2973  hypothetical protein  41.18 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3313  sterol-binding  37.29 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00254715  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1002  sterol-binding domain-containing protein  29.89 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0785  hypothetical protein  32.22 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.251796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1890  sterol-binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.019099  hitchhiker  0.00481889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6978  hypothetical protein  24.24 
 
 		 212 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.664684  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0779  hypothetical protein  39.66 
 
 		 129 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>