More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5188 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 404 aa  804    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  95.14 
 
 		 364 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  73.71 
 
 		 366 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  71.02 
 
 		 365 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  71.59 
 
 		 365 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  71.19 
 
 		 363 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  71.14 
 
 		 367 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  70.74 
 
 		 365 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  68.86 
 
 		 367 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  70.74 
 
 		 365 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  67.22 
 
 		 361 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  53.07 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  52.41 
 
 		 372 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  49.58 
 
 		 376 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  47.63 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  42.86 
 
 		 368 aa  262  8e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  41.62 
 
 		 363 aa  259  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  41.62 
 
 		 363 aa  259  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  43.63 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  41.49 
 
 		 378 aa  242  9e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  32.11 
 
 		 369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  32.11 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  32.11 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  35.36 
 
 		 368 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  31.55 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  32.2 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  31.55 
 
 		 369 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  31.92 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  31.55 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  31.64 
 
 		 369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  30.2 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  29.06 
 
 		 369 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  35.41 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  32.6 
 
 		 378 aa  153  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  34.42 
 
 		 376 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  30.48 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  33.52 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 371 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 373 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  26.55 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  29.95 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  29.68 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  29.68 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  29.68 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.68 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  29.68 
 
 		 371 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  29.68 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  33.61 
 
 		 375 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  29.41 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 		 379 aa  136  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  30.41 
 
 		 371 aa  133  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  34.08 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  32.66 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  30.19 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  34.42 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  29.62 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 		 365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  31.1 
 
 		 360 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  34.15 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  29.37 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  34.86 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  31.36 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  31.01 
 
 		 371 aa  126  7e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.48 
 
 		 418 aa  126  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  36.91 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  31.83 
 
 		 652 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.17 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  29.91 
 
 		 367 aa  123  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  33.24 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  27.87 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  32.4 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  30.94 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.08 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  32.19 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.49 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.17 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  32.12 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  27.12 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.17 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 415 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.43 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  32.54 
 
 		 652 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  31.27 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  27.98 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.68 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  32.69 
 
 		 375 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  28.65 
 
 		 666 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  33.2 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>