227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0438 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  98.8 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  93.98 
 
 		 249 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  87.95 
 
 		 249 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  67.34 
 
 		 249 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  64.92 
 
 		 249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  64.92 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  63.45 
 
 		 248 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  63.31 
 
 		 248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  61.45 
 
 		 249 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  56.4 
 
 		 251 aa  283  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  35.69 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  39.68 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  30.45 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.83 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  32.91 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  34.54 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  26.77 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  35.03 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  34.5 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  28.4 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  32.51 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  29.51 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  28.29 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  33.16 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  33.62 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  35.9 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  33.18 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  31.48 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  31.85 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  26.92 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  35.9 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.18 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  27.8 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  27.8 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.99 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.89 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  36.05 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  30.23 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.72 
 
 		 261 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  37.89 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  29.49 
 
 		 274 aa  72  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  30.19 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  30.19 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  30.19 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  30.19 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  30.19 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  30.19 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  26.82 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  30.12 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  25.49 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  32.73 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  28.24 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  26.34 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  26.34 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  35.05 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  26.53 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.94 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.67 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  28.93 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  29.6 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  26.54 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  30.06 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  30.99 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  35.29 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  30 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  30 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  33.79 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.27 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  34.64 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  25.88 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  29.49 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4005  transcriptional activator, Baf family  38.6 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.51 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  26.56 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  29.75 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  37.42 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  25.83 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  25.83 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  28.48 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  29.6 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  32.33 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  29.37 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  27.66 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  35.77 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  23.32 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  29.03 
 
 		 266 aa  62  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  29.17 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35530  pantothenate kinase  30.72 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0754114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3423  putative Baf family transcriptional acitvator  29.76 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  30.26 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  28.4 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  31.58 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  31.58 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  33.8 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  30.26 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.33 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  31.58 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>