More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0258 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_5028  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  68.52 
 
 		 467 aa  703    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1622  isopropylmalate isomerase large subunit  71.43 
 
 		 469 aa  714    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3967  isopropylmalate isomerase large subunit  68.74 
 
 		 467 aa  706    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177679  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1136  isopropylmalate isomerase large subunit  68.23 
 
 		 468 aa  714    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02781  isopropylmalate isomerase large subunit  92.31 
 
 		 468 aa  887    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2088  isopropylmalate isomerase large subunit  67.81 
 
 		 472 aa  677    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0256  isopropylmalate isomerase large subunit  68.59 
 
 		 472 aa  704    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.809992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0258  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 469 aa  974    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  67.74 
 
 		 468 aa  681    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00568531  normal  0.587637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0217  isopropylmalate isomerase large subunit  69.02 
 
 		 468 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02791  isopropylmalate isomerase large subunit  89.72 
 
 		 467 aa  889    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0248029  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0214  isopropylmalate isomerase large subunit  69.02 
 
 		 468 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00986239  hitchhiker  0.0021568 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24691  isopropylmalate isomerase large subunit  68.16 
 
 		 478 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0849  isopropylmalate isomerase large subunit  69.59 
 
 		 467 aa  711    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02821  isopropylmalate isomerase large subunit  69.94 
 
 		 471 aa  720    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03341  isopropylmalate isomerase large subunit  71 
 
 		 469 aa  713    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.6876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02891  isopropylmalate isomerase large subunit  86.35 
 
 		 469 aa  864    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.81083  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0323  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.34 
 
 		 468 aa  613  9.999999999999999e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000670591  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1604  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.17 
 
 		 474 aa  610  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135102  normal  0.0211413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2680  isopropylmalate isomerase large subunit  61.26 
 
 		 472 aa  603  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1850  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  60.74 
 
 		 474 aa  602  1.0000000000000001e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2656  isopropylmalate isomerase large subunit  58.67 
 
 		 473 aa  588  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0642  isopropylmalate isomerase large subunit  58.24 
 
 		 473 aa  588  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0901  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.82 
 
 		 474 aa  588  1e-167  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0872  isopropylmalate isomerase large subunit  58.03 
 
 		 473 aa  587  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0666  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.92 
 
 		 470 aa  580  1e-164  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2765  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.6 
 
 		 473 aa  574  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1546  aconitate hydratase domain protein  51.83 
 
 		 488 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  51.59 
 
 		 472 aa  500  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.18 
 
 		 469 aa  499  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  53.76 
 
 		 477 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  50.84 
 
 		 474 aa  498  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  52.89 
 
 		 471 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  50.53 
 
 		 471 aa  491  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.93 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  52.27 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  50.76 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.26 
 
 		 486 aa  482  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3742  isopropylmalate isomerase large subunit  49.14 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.22 
 
 		 487 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  53.1 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.93 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.68 
 
 		 481 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3334  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  48.52 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  49.24 
 
 		 473 aa  480  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  49.89 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.78 
 
 		 471 aa  480  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  49.68 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.11 
 
 		 479 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.58 
 
 		 473 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  48.05 
 
 		 474 aa  471  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1982  isopropylmalate isomerase large subunit  50.65 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211248  normal  0.733676 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  50 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.57 
 
 		 459 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  50.76 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.56 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.54 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  49.24 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3550  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.32 
 
 		 456 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.68 
 
 		 466 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  51.7 
 
 		 468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  51.06 
 
 		 468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  50.86 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  48.7 
 
 		 468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  50.11 
 
 		 466 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.13 
 
 		 493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.46 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  49.67 
 
 		 473 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  48.82 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  48.83 
 
 		 481 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  49.57 
 
 		 466 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  50.43 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  47.12 
 
 		 481 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  50.11 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.02 
 
 		 468 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  50.97 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  51.29 
 
 		 468 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.03 
 
 		 517 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1125  isopropylmalate isomerase large subunit  51.96 
 
 		 464 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1671  isopropylmalate isomerase large subunit  52.05 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  48.57 
 
 		 480 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1455  isopropylmalate isomerase large subunit  51.3 
 
 		 464 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1313  isopropylmalate isomerase large subunit  50.98 
 
 		 464 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1286  isopropylmalate isomerase large subunit  51.19 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  50.65 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  49.89 
 
 		 475 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  50.21 
 
 		 470 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1422  isopropylmalate isomerase large subunit  50.98 
 
 		 464 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3889  isopropylmalate isomerase large subunit  50.65 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1980  isopropylmalate isomerase large subunit  48.34 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  49.79 
 
 		 478 aa  463  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  50.43 
 
 		 473 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  49.03 
 
 		 476 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  48.57 
 
 		 480 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  50.96 
 
 		 469 aa  461  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1534  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.22 
 
 		 468 aa  463  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.706683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  48.91 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  47.12 
 
 		 481 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  47.12 
 
 		 481 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1324  isopropylmalate isomerase large subunit  51.52 
 
 		 464 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>