More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1671 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1671  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 456 aa  955    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2133  isopropylmalate isomerase large subunit  89.04 
 
 		 456 aa  845    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1168  isopropylmalate isomerase large subunit  67.84 
 
 		 460 aa  656    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.081215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2096  isopropylmalate isomerase large subunit  89.04 
 
 		 456 aa  845    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1324  isopropylmalate isomerase large subunit  65.2 
 
 		 464 aa  630  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3889  isopropylmalate isomerase large subunit  65.86 
 
 		 464 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1287  isopropylmalate isomerase large subunit  65.86 
 
 		 464 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1455  isopropylmalate isomerase large subunit  65.64 
 
 		 464 aa  626  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  63.64 
 
 		 471 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1725  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.68 
 
 		 457 aa  627  1e-178  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1522  isopropylmalate isomerase large subunit  65.2 
 
 		 464 aa  623  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1313  isopropylmalate isomerase large subunit  65.42 
 
 		 464 aa  621  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1422  isopropylmalate isomerase large subunit  65.42 
 
 		 464 aa  621  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1317  isopropylmalate isomerase large subunit  67.25 
 
 		 458 aa  621  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0245096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1286  isopropylmalate isomerase large subunit  65.64 
 
 		 464 aa  620  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1561  isopropylmalate isomerase large subunit  65.2 
 
 		 464 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1125  isopropylmalate isomerase large subunit  64.32 
 
 		 464 aa  618  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1493  isopropylmalate isomerase large subunit  65.2 
 
 		 464 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2030  isopropylmalate isomerase large subunit  61.06 
 
 		 458 aa  615  1e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0965841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  62.55 
 
 		 471 aa  611  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  60.3 
 
 		 477 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2225  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.42 
 
 		 471 aa  565  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.918253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.09 
 
 		 469 aa  567  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0422  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  59.19 
 
 		 471 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  58.61 
 
 		 465 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.32 
 
 		 487 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  55.11 
 
 		 469 aa  549  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.08 
 
 		 465 aa  549  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.36 
 
 		 459 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  58.62 
 
 		 484 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.26 
 
 		 517 aa  545  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3550  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.33 
 
 		 456 aa  546  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  57.54 
 
 		 484 aa  545  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  56.11 
 
 		 473 aa  545  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.04 
 
 		 479 aa  542  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  55.82 
 
 		 470 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.39 
 
 		 471 aa  542  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2802  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  57.21 
 
 		 462 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  0.228539 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  58.75 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.08 
 
 		 471 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.88 
 
 		 493 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2094  isopropylmalate isomerase large subunit  56.47 
 
 		 468 aa  537  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  55.6 
 
 		 467 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.68 
 
 		 474 aa  535  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0015  isopropylmalate isomerase large subunit  56.25 
 
 		 468 aa  535  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  56.93 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4210  isopropylmalate isomerase large subunit  56.59 
 
 		 471 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1887  isopropylmalate isomerase large subunit  56.25 
 
 		 468 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.574068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.46 
 
 		 473 aa  531  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.29 
 
 		 486 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1113  isopropylmalate isomerase large subunit  55.34 
 
 		 465 aa  531  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.681996  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  56.59 
 
 		 466 aa  531  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2453  isopropylmalate isomerase large subunit  57.69 
 
 		 487 aa  531  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.142412  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  56.28 
 
 		 468 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.34 
 
 		 468 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  56.83 
 
 		 468 aa  528  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  55.79 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  54.86 
 
 		 472 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1534  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.61 
 
 		 468 aa  530  1e-149  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.706683  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  56.28 
 
 		 468 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  54.35 
 
 		 472 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1358  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.29 
 
 		 477 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  54.6 
 
 		 481 aa  531  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23750  isopropylmalate isomerase large subunit  55.84 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168844 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18560  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.17 
 
 		 479 aa  529  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.242112  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  56.34 
 
 		 466 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.34 
 
 		 466 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1985  isopropylmalate isomerase large subunit  55.96 
 
 		 477 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682408  normal  0.0241842 
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  56.93 
 
 		 469 aa  527  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  56.34 
 
 		 466 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2012  isopropylmalate isomerase large subunit  55.41 
 
 		 474 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0300931  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  56.34 
 
 		 466 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  56.34 
 
 		 466 aa  526  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  56.34 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3470  isopropylmalate isomerase large subunit  56.03 
 
 		 466 aa  526  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  56.06 
 
 		 468 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3774  isopropylmalate isomerase large subunit  55.96 
 
 		 477 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  56.34 
 
 		 466 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  56.06 
 
 		 468 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  56.34 
 
 		 466 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.87 
 
 		 468 aa  527  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  56.49 
 
 		 470 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  55.58 
 
 		 466 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  54.33 
 
 		 481 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  56.25 
 
 		 474 aa  525  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  54.33 
 
 		 481 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  56.49 
 
 		 474 aa  525  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  56.34 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  54.33 
 
 		 481 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  56.93 
 
 		 469 aa  527  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  55.7 
 
 		 466 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1548  isopropylmalate isomerase large subunit  55.74 
 
 		 477 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1516  isopropylmalate isomerase large subunit  55.74 
 
 		 477 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  55.7 
 
 		 466 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  54.27 
 
 		 474 aa  521  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  56.34 
 
 		 468 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  54.98 
 
 		 480 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  56.25 
 
 		 472 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  54.11 
 
 		 481 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  55.86 
 
 		 472 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>