More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2030 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1725  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.59 
 
 		 457 aa  634    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2030  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 458 aa  959    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0965841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3889  isopropylmalate isomerase large subunit  61.05 
 
 		 464 aa  615  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1287  isopropylmalate isomerase large subunit  60.61 
 
 		 464 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1324  isopropylmalate isomerase large subunit  60.18 
 
 		 464 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1522  isopropylmalate isomerase large subunit  60.39 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1313  isopropylmalate isomerase large subunit  60.39 
 
 		 464 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1286  isopropylmalate isomerase large subunit  60.39 
 
 		 464 aa  608  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1422  isopropylmalate isomerase large subunit  60.39 
 
 		 464 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1455  isopropylmalate isomerase large subunit  60.83 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1125  isopropylmalate isomerase large subunit  61.05 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1671  isopropylmalate isomerase large subunit  61.06 
 
 		 456 aa  605  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1493  isopropylmalate isomerase large subunit  60.18 
 
 		 464 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1561  isopropylmalate isomerase large subunit  59.74 
 
 		 464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1168  isopropylmalate isomerase large subunit  61.78 
 
 		 460 aa  591  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.081215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2096  isopropylmalate isomerase large subunit  59.96 
 
 		 456 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2133  isopropylmalate isomerase large subunit  59.96 
 
 		 456 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  58.82 
 
 		 471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1317  isopropylmalate isomerase large subunit  60.62 
 
 		 458 aa  568  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0245096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  58.39 
 
 		 471 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.83 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  55.33 
 
 		 469 aa  524  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  55.8 
 
 		 473 aa  522  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.48 
 
 		 465 aa  519  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.94 
 
 		 474 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  55.82 
 
 		 477 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2225  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.93 
 
 		 471 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.918253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0336  isopropylmalate isomerase large subunit  55.75 
 
 		 482 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.75 
 
 		 459 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  53.39 
 
 		 465 aa  508  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.61 
 
 		 468 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0015  isopropylmalate isomerase large subunit  51.84 
 
 		 468 aa  510  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2094  isopropylmalate isomerase large subunit  51.84 
 
 		 468 aa  511  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  52.09 
 
 		 470 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1887  isopropylmalate isomerase large subunit  51.63 
 
 		 468 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.574068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4548  isopropylmalate isomerase large subunit  55.41 
 
 		 466 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.182173  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.8 
 
 		 477 aa  504  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.56 
 
 		 487 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  55.94 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  55.63 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  55.72 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  55.72 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3470  isopropylmalate isomerase large subunit  54.33 
 
 		 466 aa  504  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.64 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  55.72 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  51.82 
 
 		 481 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2802  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54.71 
 
 		 462 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  0.228539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  55.43 
 
 		 474 aa  501  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  55.87 
 
 		 474 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.03 
 
 		 471 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.21 
 
 		 493 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.78 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.35 
 
 		 481 aa  498  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  52.36 
 
 		 472 aa  500  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4234  isopropylmalate isomerase large subunit  55.22 
 
 		 474 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  54.33 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  54 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0375  isopropylmalate isomerase large subunit  54.09 
 
 		 471 aa  501  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.17 
 
 		 471 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.45 
 
 		 472 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.28 
 
 		 479 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0422  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.12 
 
 		 471 aa  498  1e-140  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0370  isopropylmalate isomerase large subunit  55.46 
 
 		 474 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3818  isopropylmalate isomerase large subunit  54.35 
 
 		 470 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  53.35 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  54 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  54 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3550  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.38 
 
 		 456 aa  498  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  54 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  54 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.84 
 
 		 517 aa  495  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  54 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  52.92 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0395  isopropylmalate isomerase large subunit  54.33 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  53.28 
 
 		 473 aa  495  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.4 
 
 		 486 aa  498  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  54 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  54 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  52.61 
 
 		 481 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  53.76 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  53.76 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  53.76 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.59 
 
 		 468 aa  497  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  52.61 
 
 		 481 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  52.39 
 
 		 481 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  51.72 
 
 		 474 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.7 
 
 		 466 aa  491  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  53.55 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1358  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.11 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  53.55 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  52.39 
 
 		 481 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  53.78 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  52.92 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1258  isopropylmalate isomerase large subunit  50.54 
 
 		 481 aa  488  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.55744  normal  0.382246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3826  isopropylmalate isomerase large subunit  53.68 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  53.26 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0337  isopropylmalate isomerase large subunit  53.9 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.301995  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  52.61 
 
 		 481 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18560  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.62 
 
 		 479 aa  488  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.242112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>