More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88066 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  73.16 
 
 		 538 aa  825    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  61.1 
 
 		 553 aa  665    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  67.91 
 
 		 567 aa  780    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  57.3 
 
 		 559 aa  657    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  100 
 
 		 527 aa  1077    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  61.1 
 
 		 553 aa  665    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  40.35 
 
 		 543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  39.62 
 
 		 551 aa  401  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  37.64 
 
 		 558 aa  390  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  36.87 
 
 		 559 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  37.84 
 
 		 543 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  39.66 
 
 		 553 aa  388  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  36.1 
 
 		 557 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  38.85 
 
 		 547 aa  383  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  37.67 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  37.86 
 
 		 545 aa  383  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  38 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  38.7 
 
 		 543 aa  381  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  38.58 
 
 		 560 aa  379  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.81 
 
 		 551 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  38.39 
 
 		 558 aa  379  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  38.34 
 
 		 554 aa  377  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  37.43 
 
 		 555 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  37.26 
 
 		 570 aa  377  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  37.26 
 
 		 560 aa  376  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  38.05 
 
 		 539 aa  378  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  37.43 
 
 		 552 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  37.64 
 
 		 551 aa  373  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  37.88 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  35.26 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  35.52 
 
 		 563 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  38 
 
 		 552 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  36.9 
 
 		 545 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  37.62 
 
 		 553 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  35.7 
 
 		 558 aa  365  1e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  36.71 
 
 		 542 aa  365  1e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  36.71 
 
 		 543 aa  365  1e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  36.52 
 
 		 542 aa  364  3e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  36.75 
 
 		 558 aa  360  3e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  37.14 
 
 		 548 aa  359  6e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  36.28 
 
 		 562 aa  358  1.9999999999999998e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  36.42 
 
 		 500 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  36.21 
 
 		 559 aa  354  2e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  37.48 
 
 		 541 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  37.71 
 
 		 554 aa  352  7e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  38.1 
 
 		 549 aa  352  1e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  37.71 
 
 		 550 aa  347  4e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.61 
 
 		 532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  33.91 
 
 		 553 aa  332  8e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.36 
 
 		 527 aa  330  3e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.56 
 
 		 530 aa  330  4e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  33.27 
 
 		 554 aa  325  1e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  34.1 
 
 		 552 aa  325  1e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.98 
 
 		 536 aa  323  5e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  33.78 
 
 		 554 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.49 
 
 		 529 aa  317  4e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.07 
 
 		 537 aa  307  3e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  33.33 
 
 		 535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  33.01 
 
 		 561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  32.38 
 
 		 548 aa  302  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  34.23 
 
 		 541 aa  301  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  31.65 
 
 		 560 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.05 
 
 		 555 aa  300  4e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.69 
 
 		 519 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  32.88 
 
 		 550 aa  293  4e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  31.29 
 
 		 547 aa  292  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  32.3 
 
 		 528 aa  291  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  31.82 
 
 		 542 aa  290  5.0000000000000004e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  29.78 
 
 		 570 aa  289  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  32.14 
 
 		 577 aa  282  8.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.8 
 
 		 546 aa  280  5e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.89 
 
 		 525 aa  279  7e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  33.01 
 
 		 536 aa  279  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.54 
 
 		 528 aa  279  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  30.57 
 
 		 535 aa  276  8e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  32.94 
 
 		 536 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  32.19 
 
 		 548 aa  274  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  31.6 
 
 		 529 aa  274  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  29.81 
 
 		 525 aa  272  9e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  32.27 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  28.44 
 
 		 563 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  31.21 
 
 		 548 aa  253  5.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  29.85 
 
 		 527 aa  250  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  30.04 
 
 		 553 aa  249  8e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  30.32 
 
 		 542 aa  247  4e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  29.6 
 
 		 533 aa  246  6e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  29.96 
 
 		 558 aa  243  5e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  28.12 
 
 		 558 aa  229  7e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  29.03 
 
 		 530 aa  229  8e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  27.56 
 
 		 568 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  29.27 
 
 		 552 aa  228  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  28.38 
 
 		 539 aa  225  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  28.46 
 
 		 534 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  28.46 
 
 		 534 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  27.55 
 
 		 546 aa  214  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  29.81 
 
 		 527 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  28.54 
 
 		 547 aa  208  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  26.57 
 
 		 541 aa  203  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  28.46 
 
 		 564 aa  203  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  27.01 
 
 		 523 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>